More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0078 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0119  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  98.4 
 
 
374 aa  733  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0091  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  99.47 
 
 
374 aa  736  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0078  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  100 
 
 
374 aa  739  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2080  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  63.54 
 
 
377 aa  470  1e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0905  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  65.5 
 
 
374 aa  433  1e-120  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0620  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  56.79 
 
 
368 aa  414  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.599525  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1735  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  59.23 
 
 
376 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.647551  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0899  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  52.44 
 
 
387 aa  351  2e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0511  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.18 
 
 
384 aa  146  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0445  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  30.18 
 
 
384 aa  146  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3542  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.28 
 
 
384 aa  133  4e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.885517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3285  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.47 
 
 
379 aa  130  4e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3117  alkaline phosphatase  28.2 
 
 
379 aa  130  5e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.768949  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2363  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.9 
 
 
378 aa  127  2e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1211  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  29.79 
 
 
378 aa  128  2e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6533  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.55 
 
 
384 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.566342  normal  0.309372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0483  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.36 
 
 
378 aa  126  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906875  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2829  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.2 
 
 
378 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2818  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.2 
 
 
378 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1242  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.42 
 
 
379 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.133775  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1311  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.42 
 
 
379 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00729464  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2204  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.2 
 
 
378 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113607  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1240  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.42 
 
 
379 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.256335  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1566  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.5 
 
 
379 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6148  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  30.26 
 
 
378 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.638199  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1641  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.61 
 
 
342 aa  123  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0465165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2909  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.55 
 
 
379 aa  122  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0756  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.81 
 
 
379 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00040589  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0655  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.81 
 
 
379 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000247191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2878  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.59 
 
 
378 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00693  cytochrome d terminal oxidase, subunit II  27.81 
 
 
379 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00792281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003920  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  28.07 
 
 
378 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0165985  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0836  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.81 
 
 
379 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00113751  normal  0.902807 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2922  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.81 
 
 
379 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.276168  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0762  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.81 
 
 
379 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00214542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00682  hypothetical protein  27.81 
 
 
379 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00900505  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0786  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.81 
 
 
379 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.90537e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2902  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.81 
 
 
379 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000842002  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01603  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.34 
 
 
378 aa  120  4e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2736  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  30.59 
 
 
378 aa  120  4e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554056  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3735  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.5 
 
 
382 aa  120  5e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.952197  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0453  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.85 
 
 
378 aa  120  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0567  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.65 
 
 
378 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1385  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.47 
 
 
379 aa  119  8e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2992  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.47 
 
 
379 aa  119  8e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3136  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.47 
 
 
379 aa  119  8e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0298  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.94 
 
 
378 aa  119  1e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601857  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1242  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.04 
 
 
379 aa  118  1e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.166295  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2978  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.21 
 
 
379 aa  119  1e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.19855e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1303  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.63 
 
 
379 aa  119  1e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.117211  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6118  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.27 
 
 
384 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.45382  normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3094  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.79 
 
 
379 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.487645  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1205  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  29.79 
 
 
378 aa  117  4e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0868  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  27.16 
 
 
379 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0959912  normal  0.0731157 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0837  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.16 
 
 
379 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.220414  normal  0.827493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0899  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  27.16 
 
 
379 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0926316  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0777  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.16 
 
 
379 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.95813e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0804  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  27.16 
 
 
379 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0162307  normal  0.359047 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1319  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.72 
 
 
379 aa  116  7e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1143  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.63 
 
 
379 aa  116  7e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.702267  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0728  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.85 
 
 
378 aa  116  8e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0621935  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1434  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.82 
 
 
378 aa  116  8e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.06586e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0560  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.85 
 
 
378 aa  116  8e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0544  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.59 
 
 
378 aa  115  9e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.972567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2869  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.59 
 
 
378 aa  115  9e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3177  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.59 
 
 
378 aa  115  9e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0147  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.59 
 
 
378 aa  115  9e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1442  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.59 
 
 
378 aa  115  9e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4149  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  28.39 
 
 
378 aa  115  1e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1231  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.91 
 
 
379 aa  115  1e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1907  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  28.46 
 
 
378 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123067  normal  0.0670629 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1149  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  25.51 
 
 
379 aa  113  4e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2640  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  28.95 
 
 
379 aa  113  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.54799e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1270  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.79 
 
 
342 aa  112  1e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019616  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2963  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.53 
 
 
379 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.133178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2875  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.53 
 
 
379 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00503727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1389  cytochrome D ubiquinol oxidase subunit II  27.53 
 
 
379 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0158938  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1453  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.25 
 
 
379 aa  109  7e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19880  Cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  28.76 
 
 
379 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2398  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  25.72 
 
 
383 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.488015  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1929  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  28.08 
 
 
342 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00828619  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1275  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  25.91 
 
 
379 aa  105  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  9.86735e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2348  cytochrome bd-I oxidase subunit II  26.42 
 
 
379 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.245309  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0364  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.64 
 
 
378 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3013  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  31.08 
 
 
342 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2713  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.38 
 
 
384 aa  103  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  1.85666e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1215  cytochrome bd-II oxidase, subunit II  26.77 
 
 
378 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2162  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  29.65 
 
 
342 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110365  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1634  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  27.93 
 
 
379 aa  103  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0257  cytochrome D ubiquinol oxidase, subunit II  27.52 
 
 
378 aa  102  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00328462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2336  cytochrome bd-II oxidase, subunit II  26.77 
 
 
378 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.807221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1087  cytochrome bd-II oxidase, subunit II  26.51 
 
 
378 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1272  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.11 
 
 
379 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102545  hitchhiker  0.000182868 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03803  Cytochrome D ubiquinol oxidase subunit II (Cytochrome BD-I oxidase subunit II)  27.49 
 
 
378 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1094  cytochrome bd-II oxidase, subunit II  26.51 
 
 
378 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0483515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2617  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.51 
 
 
378 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.75974  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11370  cytochrome d oxidase cyd, subunit II  28.77 
 
 
368 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00989  hypothetical protein  26.51 
 
 
378 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2665  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  26.51 
 
 
378 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00982  cytochrome bd-II oxidase, subunit II  26.51 
 
 
378 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.891245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>