263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0072 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1455  L-lactate permease  79.53 
 
 
551 aa  828  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.24148  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0087  L-lactate permease  97.31 
 
 
560 aa  1058  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  100 
 
 
560 aa  1095  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  100 
 
 
565 aa  1108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5019  L-lactate transport  54.58 
 
 
553 aa  592  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.05988e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5610  L-lactate permease  54.58 
 
 
553 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.80023e-07  hitchhiker  2.46487e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5342  L-lactate permease  54.58 
 
 
552 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  5.94028e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4924  L-lactate permease  54.14 
 
 
552 aa  586  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.93163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4909  L-lactate permease  54.14 
 
 
552 aa  586  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.94573e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5077  L-lactate permease  54.14 
 
 
552 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  7.46346e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5317  L-lactate permease  54.32 
 
 
552 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.99986e-40 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5400  L-lactate permease  54.14 
 
 
552 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.07113e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5349  L-lactate permease  54.22 
 
 
553 aa  587  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000100445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5464  L-lactate permease  54.14 
 
 
552 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.41601e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3763  L-lactate permease  53.86 
 
 
553 aa  582  1e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0623058  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  53.78 
 
 
551 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  53.6 
 
 
551 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  53.6 
 
 
551 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  53.78 
 
 
551 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0149  glycolate permease GlcA  60.51 
 
 
531 aa  568  1e-161  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0132  L-lactate permease  53.78 
 
 
551 aa  555  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4029  L-lactate permease  53.96 
 
 
551 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03412  hypothetical protein  53.96 
 
 
551 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3940  L-lactate permease  53.96 
 
 
551 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3909  L-lactate permease  53.78 
 
 
551 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0105  L-lactate permease  53.96 
 
 
551 aa  552  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0102  L-lactate transport  53.96 
 
 
551 aa  552  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4976  L-lactate permease  53.96 
 
 
551 aa  553  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03461  L-lactate permease  53.96 
 
 
551 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3815  L-lactate permease  53.96 
 
 
551 aa  552  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4107  L-lactate permease  53.96 
 
 
551 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  51.79 
 
 
556 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  6.53044e-06 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  52.04 
 
 
560 aa  549  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  51.43 
 
 
556 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  51.43 
 
 
556 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  51.61 
 
 
556 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1409  L-lactate permease  52.61 
 
 
547 aa  540  1e-152  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.281484  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  51.28 
 
 
545 aa  537  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  50.44 
 
 
561 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  48.17 
 
 
570 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0467  lactate permease (LctP) family protein  53.13 
 
 
548 aa  532  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  7.51768e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2806  L-lactate transport  49.03 
 
 
566 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63080  L-lactate permease  50.98 
 
 
560 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0133297  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2077  lactate permease family protein  48.96 
 
 
573 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  50.71 
 
 
562 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2673  L-lactate transport  48.86 
 
 
566 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750265  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5490  L-lactate permease  50.72 
 
 
557 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  49.21 
 
 
569 aa  531  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5896  glycolate transporter  49.82 
 
 
566 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0963775  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0461  lactate permease (LctP) family protein  48.7 
 
 
572 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0433195  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2185  lactate permease (LctP) family protein  48.87 
 
 
572 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.477622  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0870  lactate permease (LctP) family protein  48.87 
 
 
572 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1876  glycolate permease  48.7 
 
 
572 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  49.56 
 
 
564 aa  519  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1428  lactate permease family protein  48.87 
 
 
572 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0558  glycolate permease GlcA  48.7 
 
 
572 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0722  L-lactate transport  49.47 
 
 
560 aa  515  1e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3252  glycolate transporter  49.82 
 
 
560 aa  518  1e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3147  glycolate transporter  49.82 
 
 
560 aa  518  1e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3434  glycolate transporter  49.65 
 
 
560 aa  517  1e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0726  glycolate transporter  49.82 
 
 
560 aa  518  1e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02793  hypothetical protein  49.82 
 
 
560 aa  518  1e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0141341  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02843  glycolate transporter  49.82 
 
 
560 aa  518  1e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2362  L-lactate transport  50.36 
 
 
552 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1276  L-lactate transport  50.97 
 
 
557 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43260  L-lactate permease, Lldp  48.58 
 
 
561 aa  505  1e-142  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5375  L-lactate transport  48.08 
 
 
569 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715865  normal  0.520281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0394  L-lactate transport  50.37 
 
 
558 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2190  L-lactate transport  45.67 
 
 
576 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.330322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  46.44 
 
 
552 aa  471  1e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0524  L-lactate transport  47.2 
 
 
539 aa  469  1e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  6.90012e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  45.47 
 
 
592 aa  471  1e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3406  L-lactate transport  48.11 
 
 
554 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.81383e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0577  L-lactate permease  47.2 
 
 
539 aa  465  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  9.54326e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0610  L-lactate permease  47.2 
 
 
539 aa  465  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.98254e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0739  L-lactate permease  46.93 
 
 
539 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.28008e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0648  L-lactate permease  46.74 
 
 
539 aa  461  1e-128  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0527  L-lactate permease  46.46 
 
 
539 aa  462  1e-128  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.30016e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4690  L-lactate permease  46.93 
 
 
539 aa  461  1e-128  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.29192e-08  hitchhiker  1.76852e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0490  L-lactate transport  44.24 
 
 
541 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0666  L-lactate permease  47.11 
 
 
539 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.48305e-60 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0521  L-lactate permease  47.11 
 
 
539 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.74068e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0521  L-lactate permease  47.11 
 
 
539 aa  458  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.14943e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4693  L-lactate transport  45.93 
 
 
589 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880222  normal  0.0242756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0678  L-lactate permease  46.93 
 
 
539 aa  454  1e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  2.80788e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  44.83 
 
 
575 aa  441  1e-122  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  42.01 
 
 
545 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  41.34 
 
 
543 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  42.37 
 
 
551 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1957  L-lactate permease  42.52 
 
 
533 aa  407  1e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  40.49 
 
 
556 aa  407  1e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  39.89 
 
 
545 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  40.65 
 
 
552 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  39.52 
 
 
586 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2436  L-lactate transport  43.28 
 
 
532 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0097  L-lactate transport  43.31 
 
 
530 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0101  L-lactate transport  43.31 
 
 
530 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2390  L-lactate transport  43.28 
 
 
532 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  39.23 
 
 
557 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  40.72 
 
 
553 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>