More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0065 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0065  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
298 aa  591  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.78277  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0106  signal peptide peptidase SppA, 36K type  98.99 
 
 
298 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0078  signal peptide peptidase SppA, 36K type  96.64 
 
 
298 aa  570  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0228  protease IV  61.77 
 
 
297 aa  355  3.9999999999999996e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1213  signal peptide peptidase SppA, 36K type  56.63 
 
 
291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1503  signal peptide peptidase SppA, 36K type  54.06 
 
 
287 aa  295  5e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0373  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.92 
 
 
287 aa  276  2e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0119133  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0361  signal peptide peptidase SppA, 36K type  52.92 
 
 
287 aa  275  5e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.366365  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0685  peptidase S49, SppA  47.46 
 
 
289 aa  265  8e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0288  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.06 
 
 
286 aa  250  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  41.18 
 
 
296 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0236  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.67 
 
 
296 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0147104  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1703  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.36 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0423  signal peptide peptidase SppA, 36K type  39.68 
 
 
339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1881  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.72 
 
 
298 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1750  signal peptide peptidase A  33.19 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1234  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.78 
 
 
260 aa  139  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2415  periplasmic serine proteases (ClpP class)  39.17 
 
 
297 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.025979  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.1 
 
 
296 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000244919  normal  0.445804 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2119  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.5 
 
 
290 aa  138  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  unclonable  0.00000986804 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0715  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.51 
 
 
290 aa  133  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06151  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  39.42 
 
 
270 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0720976 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2329  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.86 
 
 
383 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0508  signal peptide peptidase A  33.18 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1781  peptidase S49, SppA  36.84 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2497  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.92 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.609347  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0454  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.04 
 
 
311 aa  129  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.496953 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0403  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.38 
 
 
272 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.469925  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1281  signal peptide peptidase A  39.34 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.93 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  37.19 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0583  signal peptide peptidase A  37 
 
 
273 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 
274 aa  126  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1521  signal peptide peptidase A  35.37 
 
 
316 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.290741  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13811  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  37.32 
 
 
269 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.99906  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  39.15 
 
 
269 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13731  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  36.84 
 
 
269 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.1 
 
 
299 aa  125  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2346  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.37 
 
 
382 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2434  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.37 
 
 
382 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1980  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.06 
 
 
299 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000026819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1702  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.07 
 
 
327 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000021867  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12671  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  38.28 
 
 
269 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000540358 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.02 
 
 
282 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2291  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.44 
 
 
366 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212937  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1825  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.52 
 
 
307 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0185284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1689  signal peptide peptidase A  33.63 
 
 
273 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5345  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.17 
 
 
274 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0799  signal peptide peptidase A  37.8 
 
 
269 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16541  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  37.8 
 
 
269 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1590  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.73 
 
 
307 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.152894  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2612  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.76 
 
 
334 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2285  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.62 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0392  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.26 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.163931  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2255  signal peptide peptidase SppA  31.11 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.221521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2551  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.27 
 
 
295 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.210829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4753  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.4 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0127167  hitchhiker  0.0000000108216 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2828  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.67 
 
 
331 aa  119  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289408  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3085  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.51 
 
 
348 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0032  signal peptide peptidase SppA, 36K type  36.63 
 
 
371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.557774  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1351  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.14 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1421  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.36 
 
 
326 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000360798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.85 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1916  signal peptide peptidase A  34.65 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2494  signal peptide peptidase A  30.74 
 
 
272 aa  115  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641741  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2394  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.51 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0205  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.49 
 
 
322 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0219029  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1150  signal peptide peptidase SppA, 36K type  35.61 
 
 
293 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.49 
 
 
321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.589969  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2159  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.8 
 
 
338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0023667  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0122  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.49 
 
 
321 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0697  signal peptide peptidase A  32.38 
 
 
340 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3112  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.39 
 
 
293 aa  112  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2197  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.67 
 
 
321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0154  signal peptide peptidase SppA  31 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0149  signal peptide peptidase SppA  31 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.415563  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2445  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.92 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534538  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.83 
 
 
313 aa  109  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216895  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.61 
 
 
649 aa  108  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.22 
 
 
831 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2500  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.88 
 
 
321 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  32.64 
 
 
616 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0639  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.56 
 
 
321 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0663368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3671  signal peptide peptidase A  29.35 
 
 
322 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0520  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.73 
 
 
307 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4106  signal peptide peptidase A  30.08 
 
 
303 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.827209  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0102  S49 family peptidase  32.84 
 
 
326 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0068  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.23 
 
 
326 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0824847  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0307  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.33 
 
 
324 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0166  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.93 
 
 
323 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0067  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.43 
 
 
325 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0193  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.99 
 
 
326 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.116765  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.84 
 
 
605 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0148  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.37 
 
 
314 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2929  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.31 
 
 
324 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359605  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.72 
 
 
587 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.8 
 
 
595 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0396  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.28 
 
 
325 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.302309  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2220  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.33 
 
 
323 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>