More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0063 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
159 aa  326  6e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
159 aa  326  6e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  99.37 
 
 
159 aa  325  2e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  75.48 
 
 
159 aa  253  6e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  76.47 
 
 
159 aa  249  9e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  77.24 
 
 
160 aa  249  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  71.9 
 
 
159 aa  245  2e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0687  3-dehydroquinate dehydratase  69.03 
 
 
160 aa  233  6e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.715219  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  70.47 
 
 
160 aa  233  9e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  67.74 
 
 
155 aa  228  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  55.71 
 
 
144 aa  169  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.27848e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 
142 aa  168  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 
150 aa  165  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.47 
 
 
152 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  50.69 
 
 
148 aa  163  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  52.78 
 
 
150 aa  161  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 
145 aa  160  5e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  48.28 
 
 
145 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
142 aa  157  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  45.33 
 
 
150 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 
149 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.81 
 
 
137 aa  154  5e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.75 
 
 
145 aa  153  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
146 aa  153  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.3 
 
 
144 aa  153  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
146 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
146 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 
145 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
146 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
146 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
146 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
152 aa  152  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
146 aa  152  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
146 aa  152  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
146 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  42.86 
 
 
147 aa  151  3e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.95076e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
149 aa  151  3e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 
145 aa  151  3e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
149 aa  151  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.54633e-05 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
146 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  54.07 
 
 
145 aa  149  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.95 
 
 
152 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 
147 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.59 
 
 
147 aa  148  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 
146 aa  148  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  45.89 
 
 
156 aa  148  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 
153 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 
153 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 
145 aa  147  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 
149 aa  147  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.55 
 
 
148 aa  147  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0231  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 
149 aa  147  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.447722  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 
147 aa  146  1e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 
144 aa  146  1e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 
144 aa  146  1e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.93441e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 
145 aa  145  2e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  45.89 
 
 
146 aa  145  2e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 
150 aa  145  2e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  46.58 
 
 
146 aa  144  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 
144 aa  145  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
146 aa  144  4e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 
150 aa  144  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 
150 aa  144  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
144 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  48.3 
 
 
150 aa  144  7e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 
155 aa  143  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 
150 aa  142  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  48.87 
 
 
148 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  7.97805e-05 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 
162 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 
149 aa  143  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
151 aa  143  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.75 
 
 
138 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  48 
 
 
148 aa  141  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 
166 aa  141  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 
148 aa  140  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 
152 aa  140  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.15 
 
 
184 aa  140  1e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 
148 aa  139  1e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.37 
 
 
145 aa  139  2e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.89 
 
 
149 aa  139  2e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0502  3-dehydroquinate dehydratase  51.61 
 
 
146 aa  139  2e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0028378  normal  0.126583 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 
145 aa  139  2e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 
137 aa  139  2e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  46.1 
 
 
151 aa  139  2e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  42.36 
 
 
147 aa  138  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  45.93 
 
 
150 aa  138  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 
146 aa  138  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  49.25 
 
 
153 aa  137  4e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
160 aa  137  4e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 
151 aa  137  5e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  45.39 
 
 
191 aa  137  5e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 
151 aa  137  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.78 
 
 
142 aa  137  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  44.52 
 
 
151 aa  137  8e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  48.12 
 
 
153 aa  137  8e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 
153 aa  137  8e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  45.86 
 
 
148 aa  137  8e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.76 
 
 
142 aa  137  8e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 
145 aa  136  9e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 
149 aa  136  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>