More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0060 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0060  ParaA family ATPase  100 
 
 
288 aa  574  1e-163  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0101  ParaA family ATPase  100 
 
 
288 aa  574  1e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0073  ParaA family ATPase  95.49 
 
 
288 aa  557  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0234  conserved hypothetical protein, ATPase, ParA family  79.86 
 
 
287 aa  449  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1509  ParaA family ATPase  67.01 
 
 
287 aa  388  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0366  histidinol phosphatase  67.35 
 
 
288 aa  386  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00129205  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0368  ParaA family ATPase  68.17 
 
 
289 aa  384  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141266  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  62.07 
 
 
290 aa  360  1e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00471356  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0704  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.55 
 
 
291 aa  311  8e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.92 
 
 
309 aa  162  4e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38 
 
 
301 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  33.79 
 
 
289 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  33.79 
 
 
289 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  33.67 
 
 
295 aa  147  3e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
294 aa  145  7e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0777217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  35.32 
 
 
300 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
302 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.32 
 
 
290 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1415  flagellar number regulator  33.58 
 
 
280 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.682888  normal  0.589632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.95 
 
 
288 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.38 
 
 
276 aa  142  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.56 
 
 
308 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.15 
 
 
288 aa  142  7e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  5.40188e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.4 
 
 
297 aa  142  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  33 
 
 
295 aa  142  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.53 
 
 
343 aa  141  1e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.61 
 
 
293 aa  140  2e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.91 
 
 
519 aa  139  4e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.22 
 
 
370 aa  139  4e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.54 
 
 
301 aa  139  5e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.22 
 
 
299 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.42 
 
 
287 aa  138  9e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.47298e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.42 
 
 
293 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.63 
 
 
302 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  35.68 
 
 
271 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  33.87 
 
 
304 aa  135  6e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0706  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.31 
 
 
290 aa  135  1e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.62 
 
 
275 aa  135  1e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 
295 aa  134  1e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.35 
 
 
295 aa  134  2e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
278 aa  132  7e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0326  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.59 
 
 
270 aa  132  8e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  34.32 
 
 
270 aa  132  8e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.43 
 
 
271 aa  130  2e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1208  ParaA family ATPase  33.64 
 
 
252 aa  130  2e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.97 
 
 
310 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  32.47 
 
 
309 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.4 
 
 
283 aa  129  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.86 
 
 
281 aa  129  7e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2156  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.93 
 
 
308 aa  129  8e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.99 
 
 
311 aa  128  9e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.91 
 
 
294 aa  128  1e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2698  flagellar biosynthesis like protein  33.33 
 
 
266 aa  128  1e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002831  flagellar synthesis regulator FleN  34.59 
 
 
295 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  5.17997e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.78 
 
 
291 aa  126  4e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.25 
 
 
278 aa  126  4e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0158  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.1 
 
 
271 aa  125  8e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.726569  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2291  flagellar biosynthesis protein FlhG (flagellar number regulator)  34.83 
 
 
296 aa  125  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.45 
 
 
273 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.77 
 
 
298 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03145  hypothetical protein  33.83 
 
 
295 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.09 
 
 
296 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.98 
 
 
333 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.09 
 
 
296 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.32 
 
 
296 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.4 
 
 
289 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0651  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.21 
 
 
268 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1655  ParA family protein  34.09 
 
 
313 aa  121  1e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.6019e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.74 
 
 
270 aa  121  2e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1940  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.09 
 
 
270 aa  120  2e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.403217  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.03 
 
 
274 aa  121  2e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0698  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.2 
 
 
273 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.6397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02871  flagellar biosynthetic protein FlhG  32.46 
 
 
288 aa  118  1e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742055  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.07 
 
 
303 aa  118  1e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.96 
 
 
293 aa  116  4e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.483613  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.21 
 
 
284 aa  116  4e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3052  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
293 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
293 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
293 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0524451  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2910  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
293 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1198  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.08 
 
 
293 aa  115  7e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000520334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3031  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.71 
 
 
288 aa  115  8e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2560  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.96 
 
 
293 aa  115  8e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.110554  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
293 aa  115  9e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1298  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
293 aa  115  9e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.206017  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1358  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
293 aa  115  9e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  0.103677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2806  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.6 
 
 
276 aa  114  1e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.992955  normal  0.186543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1562  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.42 
 
 
276 aa  114  2e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100295  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3873  flagellar synthesis regulator FleN  31.86 
 
 
280 aa  114  2e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.09 
 
 
293 aa  114  2e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0384925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3211  flagellar biosynthetic protein FlhG  31.17 
 
 
283 aa  114  2e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3050  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.83 
 
 
293 aa  114  2e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905912  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  27.31 
 
 
280 aa  114  2e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45640  flagellar synthesis regulator FleN  31.86 
 
 
280 aa  114  2e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555509  normal  0.237681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3438  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.42 
 
 
277 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.704285  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1978  flagellar synthesis regulator FleN  31.42 
 
 
274 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1928  flagellar biosynthesis switch protein  31.43 
 
 
275 aa  113  4e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.965527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1382  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.13 
 
 
303 aa  113  4e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0481328  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0557  flagellar synthesis regulator FleN, putative  28.68 
 
 
272 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000258989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1634  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.83 
 
 
293 aa  112  7e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>