214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0057 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
359 aa  722    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
359 aa  722    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  99.44 
 
 
359 aa  719    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  88.86 
 
 
363 aa  618  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  81.95 
 
 
363 aa  597  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  80.29 
 
 
367 aa  584  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  79.11 
 
 
366 aa  587  1e-166  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  77.14 
 
 
353 aa  548  1e-155  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  61.56 
 
 
372 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  35.71 
 
 
333 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  39.32 
 
 
329 aa  223  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  35.06 
 
 
328 aa  222  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  34.53 
 
 
331 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  34.56 
 
 
323 aa  218  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  33.43 
 
 
344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  34.48 
 
 
343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  32.43 
 
 
375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  35.06 
 
 
335 aa  211  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  33.64 
 
 
331 aa  209  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  35.58 
 
 
327 aa  209  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  34.69 
 
 
334 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  35.28 
 
 
334 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  33.62 
 
 
352 aa  205  1e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  33.63 
 
 
334 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  34.78 
 
 
359 aa  204  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  33.94 
 
 
332 aa  202  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  32.93 
 
 
334 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  35.45 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  35.22 
 
 
329 aa  199  6e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  33.03 
 
 
328 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  32.04 
 
 
330 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  34.36 
 
 
328 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  31.19 
 
 
325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  31.46 
 
 
328 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  31.46 
 
 
328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  30.93 
 
 
348 aa  175  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  31.12 
 
 
329 aa  169  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1636  flagellar motor switch protein FliM  28.27 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240245  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  27.55 
 
 
326 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  27.24 
 
 
326 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  29.39 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  28.88 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  26.91 
 
 
325 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  29.68 
 
 
351 aa  139  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  27.96 
 
 
334 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  28.01 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  28.01 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  27.13 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  26.99 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  28.61 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  26.91 
 
 
352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  26.77 
 
 
333 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  27.56 
 
 
326 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  29.31 
 
 
326 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  25.81 
 
 
347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  26.23 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  25.75 
 
 
332 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  26.23 
 
 
333 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  26.95 
 
 
332 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  26.95 
 
 
332 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  24.56 
 
 
314 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  26.69 
 
 
341 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  26.33 
 
 
332 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  27.57 
 
 
338 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  26.95 
 
 
332 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  26.35 
 
 
332 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  26.07 
 
 
342 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 
334 aa  122  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2721  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 
334 aa  122  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048647  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2178  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 
334 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  26.35 
 
 
332 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  26.35 
 
 
332 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  26.35 
 
 
332 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  26.69 
 
 
334 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2045  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 
334 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0461254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 
334 aa  122  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
334 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2134  flagellar motor switch protein FliM  26.69 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2192  flagellar motor switch protein FliM  26.69 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  0.814379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  28.12 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1266  flagellar motor switch protein FliM  26.69 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1143  flagellar motor switch protein FliM  26.69 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  26.51 
 
 
335 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2139  flagellar motor switch protein FliM  26.69 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  25.53 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  25.38 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  24.55 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  25.99 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  27.25 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  25.43 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1703  flagellar motor switch protein FliM  26.99 
 
 
334 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0313377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  27 
 
 
332 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  25.47 
 
 
337 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  25.38 
 
 
343 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  25.38 
 
 
343 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  26.61 
 
 
342 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  26.65 
 
 
337 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  27 
 
 
332 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>