59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0055 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  100 
 
 
198 aa  403  1e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  97.99 
 
 
199 aa  395  1e-109  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0096  peptidase family protein  97.67 
 
 
129 aa  264  7e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  51.6 
 
 
197 aa  204  8e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0095  peptidase family protein  95 
 
 
67 aa  117  2e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  30.22 
 
 
244 aa  76.3  3e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0129  peptidase family protein  87.18 
 
 
37 aa  69.7  3e-11  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  32.14 
 
 
234 aa  65.1  6e-10  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  26.71 
 
 
237 aa  63.9  1e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  27.91 
 
 
203 aa  63.5  2e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  26.71 
 
 
237 aa  62  6e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  29.08 
 
 
253 aa  61.2  8e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  27.08 
 
 
253 aa  61.2  8e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  28.87 
 
 
231 aa  60.8  1e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  29.08 
 
 
253 aa  61.2  1e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  26.24 
 
 
238 aa  60.1  2e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  26.24 
 
 
238 aa  60.1  2e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  28.28 
 
 
226 aa  60.5  2e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  28.57 
 
 
234 aa  60.1  2e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  27.66 
 
 
209 aa  58.9  4e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  26.7 
 
 
235 aa  58.9  5e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  27.33 
 
 
236 aa  58.5  6e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  30.5 
 
 
226 aa  58.2  8e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  28.17 
 
 
266 aa  58.2  9e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  28.37 
 
 
235 aa  57.4  1e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  26.46 
 
 
232 aa  57.8  1e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  26.24 
 
 
237 aa  56.6  2e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  27.67 
 
 
727 aa  55.8  4e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  24.14 
 
 
234 aa  55.1  7e-07  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  27.97 
 
 
227 aa  55.1  7e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  25.17 
 
 
716 aa  53.9  2e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  27.32 
 
 
235 aa  53.1  3e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  9.36066e-05 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.11 
 
 
1019 aa  53.1  3e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  28.68 
 
 
225 aa  52.4  4e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  23.45 
 
 
227 aa  52  6e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  27.56 
 
 
223 aa  52  6e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  23.45 
 
 
227 aa  51.6  7e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  24.14 
 
 
760 aa  50.8  1e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  27.66 
 
 
226 aa  50.1  2e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  24.84 
 
 
1038 aa  50.1  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  27.66 
 
 
226 aa  50.4  2e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  27.66 
 
 
226 aa  49.3  3e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  24.2 
 
 
1038 aa  48.9  4e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  24.82 
 
 
261 aa  48.5  6e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  27.7 
 
 
737 aa  48.1  8e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  25.32 
 
 
251 aa  48.1  8e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.06928e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  25.48 
 
 
251 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  26.95 
 
 
226 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl264  putative multidrug ABC transporter  24.32 
 
 
608 aa  45.8  0.0004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.04334e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15711  hypothetical protein  25.58 
 
 
731 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  25.83 
 
 
738 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  25.36 
 
 
726 aa  44.7  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  22.45 
 
 
734 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  22.45 
 
 
734 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  26.09 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  26.35 
 
 
738 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  24.1 
 
 
735 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  23.02 
 
 
521 aa  42  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.28778e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  30.85 
 
 
741 aa  41.2  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>