84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0036 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  100 
 
 
347 aa  716  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  99.42 
 
 
347 aa  714  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  99.71 
 
 
347 aa  715  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  37.11 
 
 
363 aa  222  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  35.1 
 
 
347 aa  213  3e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  36.05 
 
 
343 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  33.07 
 
 
331 aa  139  6e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  32.68 
 
 
306 aa  131  2e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  30.83 
 
 
329 aa  129  9e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  32.34 
 
 
358 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  32.35 
 
 
369 aa  123  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  31.67 
 
 
361 aa  123  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  32.35 
 
 
357 aa  122  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  31.91 
 
 
352 aa  112  1e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  30.65 
 
 
306 aa  111  2e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  31.67 
 
 
329 aa  111  2e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  33.05 
 
 
272 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  30.58 
 
 
333 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  30.35 
 
 
327 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  29.17 
 
 
327 aa  103  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  32.67 
 
 
675 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  30.93 
 
 
269 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  32.18 
 
 
675 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  26.97 
 
 
282 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  6.43985e-07  hitchhiker  2.02689e-05 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  31.28 
 
 
691 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  29.71 
 
 
698 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  30.52 
 
 
728 aa  89.7  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  31.65 
 
 
310 aa  89.7  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  29.96 
 
 
712 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.21 
 
 
699 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  28.57 
 
 
343 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  28.51 
 
 
669 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.1 
 
 
726 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  31 
 
 
708 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  25.24 
 
 
721 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  30.05 
 
 
773 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  25.48 
 
 
694 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  24.92 
 
 
721 aa  85.5  1e-15  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  26.45 
 
 
352 aa  85.5  1e-15  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.5 
 
 
689 aa  84.7  2e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  27.92 
 
 
327 aa  83.6  5e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  26.52 
 
 
350 aa  80.9  3e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  26.16 
 
 
353 aa  80.9  3e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  28.09 
 
 
304 aa  80.5  4e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  27.78 
 
 
304 aa  79.3  8e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  28.75 
 
 
291 aa  79  1e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  27.46 
 
 
308 aa  78.6  1e-13  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  25.68 
 
 
355 aa  78.2  2e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  29.34 
 
 
311 aa  78.6  2e-13  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  28.16 
 
 
303 aa  78.6  2e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  27.04 
 
 
304 aa  77.4  3e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  26.49 
 
 
351 aa  77.8  3e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  25.68 
 
 
355 aa  77.4  4e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  26.95 
 
 
343 aa  77  4e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  27.04 
 
 
304 aa  77.4  4e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  25.68 
 
 
355 aa  77  5e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  26.64 
 
 
315 aa  76.6  6e-13  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  26.19 
 
 
351 aa  76.3  7e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  26.69 
 
 
355 aa  76.3  7e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  5.03789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  26.38 
 
 
317 aa  75.5  1e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  25.89 
 
 
351 aa  75.5  1e-12  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  25.89 
 
 
352 aa  74.7  2e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  27.31 
 
 
293 aa  73.2  7e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  25.99 
 
 
372 aa  72.4  1e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  25.85 
 
 
313 aa  71.6  2e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  26.87 
 
 
337 aa  71.6  2e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  24.57 
 
 
407 aa  70.1  5e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  25.42 
 
 
309 aa  68.9  1e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  24.57 
 
 
407 aa  68.6  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  22.46 
 
 
346 aa  63.9  3e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  32.26 
 
 
181 aa  63.2  7e-09  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  36.13 
 
 
139 aa  63.2  7e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  41.98 
 
 
125 aa  55.1  2e-06  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  25 
 
 
671 aa  52.4  1e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  32.93 
 
 
185 aa  51.2  3e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  32.14 
 
 
181 aa  51.2  3e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3662  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.35 
 
 
294 aa  46.6  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  31.48 
 
 
130 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.93 
 
 
293 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1455  cytochrome c class I  34.62 
 
 
278 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.71587e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  28.57 
 
 
179 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_004310  BR0360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.8 
 
 
287 aa  43.1  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  30.12 
 
 
225 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  45.24 
 
 
647 aa  42.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>