54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0033 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0033  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  465  1e-130  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0072  hypothetical protein  97.42 
 
 
233 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0108792  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0048  hypothetical protein  96.57 
 
 
253 aa  452  1e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.411196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2104  hypothetical protein  46.15 
 
 
239 aa  222  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0087  hypothetical protein  45.73 
 
 
239 aa  218  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001628  putative periplasmic protein  44.16 
 
 
239 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00837  hypothetical protein  43.53 
 
 
239 aa  216  3e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2301  hypothetical protein  48.82 
 
 
238 aa  215  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1109  hypothetical protein  46.05 
 
 
262 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2080  protein of unknown function DUF541  45.53 
 
 
239 aa  206  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0404396  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2109  protein of unknown function DUF541  46.79 
 
 
228 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2154  hypothetical protein  44.35 
 
 
239 aa  203  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2773  hypothetical protein  46.44 
 
 
238 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  9.68246e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2472  hypothetical protein  46.44 
 
 
238 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.42e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2793  hypothetical protein  46.44 
 
 
238 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.63399e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1585  protein of unknown function DUF541  46.44 
 
 
238 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.24406e-06  hitchhiker  1.06275e-10 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2438  hypothetical protein  46.32 
 
 
236 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  3.55318e-08  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1448  hypothetical protein  45.96 
 
 
250 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.47149e-07  unclonable  7.12925e-11 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03216  hypothetical protein  43.91 
 
 
247 aa  202  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000893493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3101  hypothetical protein  46.38 
 
 
238 aa  201  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2868  hypothetical protein  46.03 
 
 
238 aa  200  1e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000991605  normal  0.689534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1460  hypothetical protein  45.53 
 
 
238 aa  200  2e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  6.34241e-05  unclonable  2.76255e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1395  hypothetical protein  45.53 
 
 
238 aa  200  2e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  8.11634e-08  unclonable  1.43355e-11 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2412  hypothetical protein  43.84 
 
 
245 aa  199  2e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.377805  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1910  protein of unknown function DUF541  43.23 
 
 
239 aa  199  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1616  hypothetical protein  45.85 
 
 
238 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.00247e-06  decreased coverage  1.63604e-07 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3039  hypothetical protein  45.85 
 
 
238 aa  198  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0172868  normal  0.01799 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1140  hypothetical protein  42.61 
 
 
241 aa  195  4e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.114572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2180  hypothetical protein  42.86 
 
 
238 aa  187  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  2.67555e-09  normal  0.0119048 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1748  hypothetical protein  41.2 
 
 
232 aa  149  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0569  protein of unknown function DUF541  39.22 
 
 
241 aa  145  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0339808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0525  hypothetical protein  39.05 
 
 
241 aa  138  9e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426488  normal  0.0754297 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1426  hypothetical protein  35.65 
 
 
237 aa  137  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.174066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3473  hypothetical protein  32.2 
 
 
236 aa  120  1e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2487  hypothetical protein  34.27 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.375164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3038  hypothetical protein  27.44 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K09  hypothetical protein  29.06 
 
 
231 aa  84.7  1e-15  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  1.8961e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1567  hypothetical protein  28.71 
 
 
246 aa  84  2e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1997  hypothetical protein  27.96 
 
 
261 aa  81.3  1e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  7.36742e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10868  hypothetical protein  29.17 
 
 
242 aa  80.5  2e-14  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1832  hypothetical protein  28.11 
 
 
249 aa  76.6  3e-13  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1796  hypothetical protein  28.11 
 
 
249 aa  76.6  3e-13  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.193183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1996  protein of unknown function DUF541  26.32 
 
 
246 aa  67.8  1e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.278766 
 
 
-
 
NC_002950  PG0356  hypothetical protein  22.17 
 
 
260 aa  65.1  8e-10  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.187061 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2326  hypothetical protein  26.6 
 
 
250 aa  62  7e-09  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2255  protein of unknown function DUF541  26.03 
 
 
238 aa  60.1  3e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0374125  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17101  periplasmic protein  26.87 
 
 
259 aa  58.9  6e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0957  hypothetical protein  25.59 
 
 
254 aa  56.6  4e-07  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0472  protein of unknown function DUF541  23.18 
 
 
244 aa  53.5  3e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.43999e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04361  periplasmic protein  24.52 
 
 
260 aa  50.8  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0370  putative periplasmic protein  24.4 
 
 
260 aa  48.5  9e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16350  hypothetical protein  24.43 
 
 
141 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04251  periplasmic protein  25 
 
 
260 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  23.96 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>