150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0031 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  81.57 
 
 
1244 aa  1946  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  35.27 
 
 
1299 aa  640  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  65.68 
 
 
1252 aa  1507  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  56.34 
 
 
1256 aa  1292  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  100 
 
 
1257 aa  2519  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  41.03 
 
 
1186 aa  537  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  32.76 
 
 
1194 aa  493  1e-138  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  31.03 
 
 
1209 aa  382  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  31.98 
 
 
1132 aa  379  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  38.68 
 
 
1177 aa  307  1e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  28.72 
 
 
1154 aa  288  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  38.37 
 
 
1120 aa  277  1e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  29.27 
 
 
1076 aa  261  8e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  33.93 
 
 
1159 aa  239  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  33.68 
 
 
1147 aa  229  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  32.8 
 
 
995 aa  222  3e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  31.51 
 
 
1036 aa  213  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  32.14 
 
 
1426 aa  196  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  42.53 
 
 
247 aa  175  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  27.27 
 
 
974 aa  174  8e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.40584e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  22.74 
 
 
1432 aa  168  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  29.96 
 
 
410 aa  150  2e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.02601e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  28.07 
 
 
1338 aa  150  2e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  26.27 
 
 
1089 aa  141  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  23.2 
 
 
1612 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  25.88 
 
 
1058 aa  126  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  22.67 
 
 
1104 aa  110  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  26.51 
 
 
404 aa  110  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.64391e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  21.9 
 
 
1184 aa  108  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  22.74 
 
 
1210 aa  107  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  1.20393e-06 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  25.29 
 
 
1298 aa  105  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  22.17 
 
 
1461 aa  97.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  23.4 
 
 
1020 aa  96.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1179  hypothetical protein  22.17 
 
 
1452 aa  97.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  24.9 
 
 
1170 aa  96.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  29.82 
 
 
1088 aa  95.5  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  34.16 
 
 
416 aa  95.5  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  26.4 
 
 
1178 aa  93.6  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  24.87 
 
 
838 aa  87.8  1e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  24.22 
 
 
1712 aa  87.4  2e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  20.47 
 
 
1282 aa  87.4  2e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  22.52 
 
 
1333 aa  87  2e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  20.24 
 
 
1290 aa  85.9  5e-15  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  30.15 
 
 
1041 aa  84  2e-14  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  21.91 
 
 
518 aa  82  6e-14  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  23.08 
 
 
882 aa  82  7e-14  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5355  hypothetical protein  22.57 
 
 
1409 aa  80.9  1e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614954  normal  0.368867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  22.6 
 
 
1441 aa  80.5  2e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  25.06 
 
 
1039 aa  80.5  2e-13  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  23.53 
 
 
562 aa  79.7  3e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.27479e-11 
 
 
-
 
NC_011783  BbuZS7_E01  putative type I restriction/modofication enzyme  25.96 
 
 
1277 aa  79.3  5e-13  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  22.43 
 
 
1321 aa  78.2  9e-13  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0223  hypothetical protein  21.83 
 
 
1342 aa  78.2  1e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0122903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  17.86 
 
 
1243 aa  76.6  3e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  22.29 
 
 
950 aa  76.6  3e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  20.71 
 
 
1347 aa  75.9  5e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  22.68 
 
 
1336 aa  75.9  5e-12  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  22.05 
 
 
1343 aa  75.5  6e-12  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  27.47 
 
 
1250 aa  75.1  7e-12  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  34.56 
 
 
694 aa  75.1  8e-12  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  24.84 
 
 
522 aa  74.7  9e-12  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  27.47 
 
 
1250 aa  74.7  9e-12  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  25.08 
 
 
493 aa  74.7  1e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  23.29 
 
 
1354 aa  73.9  2e-11  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  22.69 
 
 
1022 aa  73.2  3e-11  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H19  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  24.2 
 
 
1278 aa  73.2  3e-11  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.218892  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  25.59 
 
 
570 aa  73.2  3e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  24.59 
 
 
1373 aa  72.4  5e-11  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  22.69 
 
 
1375 aa  72  8e-11  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  22.11 
 
 
1338 aa  70.9  1e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  21.7 
 
 
836 aa  71.2  1e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3298  putative type II DNA modification enzyme  28.14 
 
 
1322 aa  69.7  3e-10  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1466  putative type II DNA modification enzyme  22.8 
 
 
1219 aa  69.3  4e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233784  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  20.77 
 
 
1339 aa  69.3  5e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  20.77 
 
 
1339 aa  69.3  5e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  25.13 
 
 
1338 aa  68.6  7e-10  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  23.17 
 
 
1359 aa  68.6  7e-10  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  19.48 
 
 
1339 aa  68.2  9e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  31.11 
 
 
652 aa  67.8  1e-09  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  20.94 
 
 
1422 aa  66.6  3e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2199  hypothetical protein  26 
 
 
846 aa  66.2  4e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  22.13 
 
 
1365 aa  65.9  4e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  23.7 
 
 
478 aa  66.2  4e-09  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1525  hypothetical protein  21.32 
 
 
1459 aa  65.9  4e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0847093 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  22.09 
 
 
557 aa  66.2  4e-09  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0353  type II restriction enzyme, methylase subunit  22.39 
 
 
1573 aa  66.2  4e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1272  hypothetical protein  21.88 
 
 
1353 aa  65.5  6e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4829  hypothetical protein  26.87 
 
 
1640 aa  65.5  6e-09  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4895  type II restriction enzyme, methylase subunit  25.37 
 
 
1640 aa  64.7  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5809  hypothetical protein  25.37 
 
 
1644 aa  64.7  1e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3884  hypothetical protein  25.37 
 
 
1642 aa  64.7  1e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  24.01 
 
 
527 aa  63.5  2e-08  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  22.5 
 
 
1306 aa  63.9  2e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1421  putative type II DNA modification enzyme  27.14 
 
 
1355 aa  64.3  2e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  20.11 
 
 
1241 aa  63.5  3e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0354  putative type II DNA modification enzyme  20.44 
 
 
1319 aa  62.8  4e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.257085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  23.67 
 
 
629 aa  62.8  5e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  20.37 
 
 
1366 aa  61.6  8e-08  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  26.63 
 
 
1358 aa  62  8e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0724  putative type II DNA modification enzyme  22.22 
 
 
1321 aa  60.8  2e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>