More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0028 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0030  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  98.66 
 
 
523 aa  1048  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0055  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  99.62 
 
 
523 aa  1055  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  62.79 
 
 
535 aa  686  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0028  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 
523 aa  1056  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.85142  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0013  single-stranded-DNA specific exonuclease  68.58 
 
 
523 aa  761  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2085  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.57 
 
 
525 aa  644  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0350737  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1755  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  61.11 
 
 
530 aa  655  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0133  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.63 
 
 
524 aa  612  1e-174  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.556564  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0046  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.83 
 
 
527 aa  593  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2081  RecJ exonuclease  43.3 
 
 
537 aa  432  1e-120  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.71 
 
 
814 aa  310  3e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.95428e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.01 
 
 
573 aa  310  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  34.82 
 
 
568 aa  308  2e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.64 
 
 
757 aa  305  1e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.64 
 
 
757 aa  305  1e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  36.62 
 
 
932 aa  301  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.73 
 
 
568 aa  298  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.3 
 
 
732 aa  296  4e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.7 
 
 
574 aa  296  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1199  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.06 
 
 
757 aa  293  7e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 
989 aa  292  9e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  32.43 
 
 
592 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.2 
 
 
788 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0656  exonuclease RecJ  35 
 
 
742 aa  290  4e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.48 
 
 
568 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.87 
 
 
779 aa  287  3e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.07 
 
 
773 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.07 
 
 
779 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.07 
 
 
779 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.39 
 
 
578 aa  285  2e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0519  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.24 
 
 
1120 aa  285  2e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.388344  hitchhiker  0.00158278 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.87 
 
 
779 aa  283  5e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34083e-09 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.87 
 
 
779 aa  283  6e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  32.87 
 
 
779 aa  283  7e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.87 
 
 
779 aa  283  7e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.43 
 
 
801 aa  283  8e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.75309e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  33.39 
 
 
566 aa  280  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  32.68 
 
 
779 aa  280  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.5 
 
 
827 aa  278  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  5.97878e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.48 
 
 
779 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.48 
 
 
779 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0891  RecJ exonuclease  33.33 
 
 
584 aa  276  5e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1070  single-stranded DNA-specific exonuclease  33.2 
 
 
622 aa  274  2e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.03 
 
 
564 aa  274  3e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.44 
 
 
907 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  1.29081e-06 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.04 
 
 
785 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  5.79618e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.97 
 
 
557 aa  271  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0436737  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0338  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.63 
 
 
1035 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.191067  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.01 
 
 
568 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.27 
 
 
589 aa  267  3e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1409  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.51 
 
 
578 aa  267  3e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0667264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  30.3 
 
 
578 aa  267  3e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1474  single-stranded DNA-specific exonuclease  32.18 
 
 
655 aa  267  3e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0876  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.13 
 
 
592 aa  267  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0250964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2036  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.05 
 
 
592 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.66 
 
 
798 aa  266  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  32.25 
 
 
581 aa  266  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.98 
 
 
572 aa  266  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.89 
 
 
885 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  9.34537e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.03 
 
 
586 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.2 
 
 
568 aa  266  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550153 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1953  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.98 
 
 
576 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  31.56 
 
 
573 aa  264  3e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2322  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.85 
 
 
592 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.14 
 
 
977 aa  263  4e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  31.94 
 
 
566 aa  263  5e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2080  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.39 
 
 
580 aa  263  8e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0780382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.98 
 
 
573 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.1 
 
 
569 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0687  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.62 
 
 
574 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449163  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  31.84 
 
 
566 aa  261  3e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1209  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.91 
 
 
955 aa  260  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00300001  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  31.85 
 
 
574 aa  259  7e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1246  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  33.69 
 
 
955 aa  259  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  6.05261e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.38 
 
 
579 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21910  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.45 
 
 
1102 aa  259  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0138959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.59 
 
 
574 aa  259  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  31.56 
 
 
579 aa  257  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.71 
 
 
584 aa  256  6e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  31.47 
 
 
736 aa  256  9e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.9 
 
 
599 aa  256  9e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2948  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.81 
 
 
603 aa  255  1e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181074  hitchhiker  0.00226197 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0826  single-stranded DNA-specific exonuclease  31.64 
 
 
756 aa  255  1e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00114457  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.17 
 
 
570 aa  255  2e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  32.7 
 
 
569 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.593595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.24 
 
 
584 aa  254  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.68 
 
 
569 aa  253  4e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.61 
 
 
865 aa  253  5e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.12 
 
 
571 aa  253  5e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0845  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.57 
 
 
577 aa  253  5e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.49 
 
 
569 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.16 
 
 
571 aa  253  7e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.09 
 
 
579 aa  253  8e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04000  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.26 
 
 
1134 aa  252  9e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.544211 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3522  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.39 
 
 
577 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.02 
 
 
584 aa  252  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  30.72 
 
 
577 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0895  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.59 
 
 
574 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  32.68 
 
 
579 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  31.11 
 
 
569 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>