More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0022 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0022  RNA pseudouridylate synthase family protein  100 
 
 
300 aa  603  1e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0049  RNA pseudouridine synthase family protein  97 
 
 
300 aa  590  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0024  RNA pseudouridine synthase family protein  95.67 
 
 
300 aa  579  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0023  putative ribosomal pseudouridine synthase  68.47 
 
 
300 aa  421  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.835317  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1120  putative prophage LambdaCh01, recombination protein Bet  55.07 
 
 
305 aa  345  4e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1741  RNA pseudouridine synthase  50.99 
 
 
304 aa  310  2e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1893  disulfide isomerase  50.68 
 
 
307 aa  305  5e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1818  RNA pseudouridine synthase  47.77 
 
 
319 aa  296  3e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0056  pseudouridine synthase  40.54 
 
 
302 aa  239  3e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2094  pseudouridine synthase, RluD  39 
 
 
304 aa  217  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  29.72 
 
 
318 aa  133  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  28.62 
 
 
327 aa  133  4e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1559  pseudouridine synthase, RluA family  30.74 
 
 
344 aa  133  4e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.627219  hitchhiker  0.0055148 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  37.37 
 
 
331 aa  131  1e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  35.34 
 
 
306 aa  129  5e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.62 
 
 
438 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6286  pseudouridine synthase, RluD  25.8 
 
 
402 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1793  RluA family pseudouridine synthase  25.8 
 
 
402 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  25.8 
 
 
402 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.77 
 
 
301 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1817  RluA family pseudouridine synthase  25.63 
 
 
360 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294999 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1704  RluA family pseudouridine synthase  25.71 
 
 
407 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1958  RluA family pseudouridine synthase  28.03 
 
 
293 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.576308  normal  0.790812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  25.79 
 
 
405 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0998  pseudouridine synthase, RluA family  30.36 
 
 
547 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.012801 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0386  RluA family pseudouridine synthase  29.37 
 
 
303 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0967  RluA family pseudouridine synthase  27.43 
 
 
436 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0008  pseudouridine synthase, RluA family  28.83 
 
 
323 aa  120  2e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1841  pseudouridine synthase, RluA family  28.32 
 
 
431 aa  120  2e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.168334 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  27.21 
 
 
400 aa  121  2e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.05 
 
 
391 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  37.16 
 
 
304 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  7.16198e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  30.25 
 
 
319 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  33.33 
 
 
315 aa  119  5e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.04 
 
 
303 aa  119  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  25.93 
 
 
325 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.21 
 
 
318 aa  119  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0486  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  31.37 
 
 
337 aa  118  1e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.766955  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0318  RluA  34.22 
 
 
299 aa  118  1e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.71 
 
 
318 aa  117  2e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.33 
 
 
334 aa  117  2e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2950  RluA family pseudouridine synthase  27.34 
 
 
323 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118178  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1591  pseudouridine synthase, RluA family  28.22 
 
 
370 aa  116  4e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  decreased coverage  0.00904495 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.25 
 
 
296 aa  116  4e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4308  pseudouridine synthase, RluA family  28.21 
 
 
323 aa  116  4e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  30.14 
 
 
326 aa  116  4e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2197  pseudouridylate synthase  33.48 
 
 
224 aa  116  4e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0395  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  30.26 
 
 
322 aa  116  5e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  30.36 
 
 
314 aa  116  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.7 
 
 
305 aa  115  7e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1919  pseudouridine synthase, RluA family  27.3 
 
 
370 aa  115  7e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338974  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2850  pseudouridine synthase, RluA family  31.72 
 
 
325 aa  115  1e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2333  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.1 
 
 
395 aa  115  1e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.24 
 
 
296 aa  115  1e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  31.95 
 
 
311 aa  115  1e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0083  RluA family pseudouridine synthase  25.24 
 
 
389 aa  115  1e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1324  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.1 
 
 
395 aa  115  1e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1813  RluA family pseudouridine synthase  25.24 
 
 
389 aa  115  1e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1084  RluA family pseudouridine synthase  25.24 
 
 
389 aa  115  1e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.346306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4321  RluA family pseudouridine synthase  26.91 
 
 
350 aa  114  2e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  28.67 
 
 
316 aa  114  2e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1628  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D protein  30.97 
 
 
358 aa  114  2e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2168  RluA family pseudouridine synthase  25.24 
 
 
389 aa  114  2e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2205  RluA family pseudouridine synthase  28.1 
 
 
395 aa  114  2e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0540  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.9 
 
 
323 aa  114  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.373783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  30.36 
 
 
299 aa  113  4e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0372  pseudouridine synthase, RluA family  32.63 
 
 
334 aa  113  4e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  28.83 
 
 
315 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4330  pseudouridine synthase, RluA family  26.79 
 
 
323 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  29.92 
 
 
305 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0593  pseudouridine synthase, RluA family  26.95 
 
 
310 aa  112  7e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.070842  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4177  pseudouridine synthase, RluD  28.57 
 
 
318 aa  112  7e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.463318  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  31.71 
 
 
311 aa  112  8e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0431  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  26.95 
 
 
319 aa  112  8e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1072  RluA family pseudouridine synthase  28.23 
 
 
349 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0863187  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01005  23S rRNA pseudouridine synthase D  32.09 
 
 
325 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1002  pseudouridine synthase, RluA family  32.79 
 
 
325 aa  112  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1017  RluA family pseudouridine synthase  33.71 
 
 
324 aa  111  1e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.95395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  32.88 
 
 
305 aa  111  1e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33477  DRAP deaminase  33.62 
 
 
585 aa  112  1e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.261571 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  32.88 
 
 
305 aa  111  1e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1985  RluA family pseudouridine synthase  26.63 
 
 
377 aa  112  1e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122684  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.8 
 
 
323 aa  111  1e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.5802e-07  normal  0.354843 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1119  RluA family pseudouridine synthase  33.71 
 
 
324 aa  111  1e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.17979e-06  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3074  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.8 
 
 
323 aa  111  1e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000195279  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3272  pseudouridine synthase, RluA family  33.71 
 
 
324 aa  111  1e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.67118e-09  normal  0.0414307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1086  RluA family pseudouridine synthase  33.71 
 
 
324 aa  111  1e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  7.50012e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  32.08 
 
 
302 aa  112  1e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3536  ribosomal large subunit pseudouridine synthase RluD subfamily  28.32 
 
 
342 aa  112  1e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.618363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3499  lysozyme  26.55 
 
 
323 aa  111  2e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.847735  normal  0.0395097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1612  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.45 
 
 
356 aa  110  2e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000933226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6759  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.36 
 
 
326 aa  110  2e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0947  pseudouridine synthase, RluA family  29.29 
 
 
345 aa  110  2e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.48756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.05 
 
 
403 aa  110  2e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270637  normal  0.743014 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  33.88 
 
 
305 aa  110  2e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3171  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.95 
 
 
323 aa  111  2e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.61033e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2118  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.3 
 
 
337 aa  110  2e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.05 
 
 
304 aa  110  2e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0061  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.08 
 
 
321 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102185  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  32.37 
 
 
302 aa  110  4e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.69242e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>