More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0016 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0016  ExsB  100 
 
 
224 aa  453  1e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  99.11 
 
 
224 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  99.11 
 
 
224 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  72.73 
 
 
221 aa  326  2e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  66.22 
 
 
223 aa  297  1e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  64.86 
 
 
223 aa  292  3e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  62.9 
 
 
221 aa  281  7e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  61.19 
 
 
220 aa  275  4e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  62.9 
 
 
224 aa  264  6e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  46.82 
 
 
220 aa  213  1e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  45.7 
 
 
222 aa  206  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  46.61 
 
 
222 aa  203  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  44.55 
 
 
226 aa  201  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  45 
 
 
226 aa  201  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  45.74 
 
 
257 aa  200  1e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  44.34 
 
 
258 aa  200  2e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  48.43 
 
 
222 aa  197  1e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  43.64 
 
 
227 aa  197  1e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  45.18 
 
 
229 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  44.14 
 
 
221 aa  195  5e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  43.64 
 
 
226 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  42.73 
 
 
226 aa  191  6e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  45.74 
 
 
227 aa  191  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  40 
 
 
243 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  44.39 
 
 
233 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.08637e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  42.45 
 
 
218 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  40.27 
 
 
229 aa  183  2e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  38.46 
 
 
251 aa  182  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  42.11 
 
 
225 aa  171  7e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  38.74 
 
 
271 aa  171  8e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  40.79 
 
 
241 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  41.74 
 
 
230 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  41.05 
 
 
229 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.53404e-08  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  40.09 
 
 
224 aa  166  3e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  39.74 
 
 
228 aa  165  6e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  41.41 
 
 
230 aa  165  6e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  41.7 
 
 
222 aa  164  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  40.62 
 
 
224 aa  164  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  39.65 
 
 
224 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  42.22 
 
 
244 aa  164  1e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  39.65 
 
 
224 aa  164  1e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  42.22 
 
 
226 aa  164  1e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  39.27 
 
 
225 aa  164  1e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  38.22 
 
 
224 aa  163  2e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  41.15 
 
 
237 aa  163  2e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  39.27 
 
 
225 aa  162  4e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  41.23 
 
 
225 aa  161  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  41.67 
 
 
225 aa  161  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  40.09 
 
 
232 aa  159  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.28539e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  41.67 
 
 
228 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  36.68 
 
 
226 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  38.22 
 
 
226 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  40.89 
 
 
227 aa  159  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  4.8435e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  41.23 
 
 
234 aa  158  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  38.77 
 
 
224 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  7.03334e-11  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  39.91 
 
 
233 aa  158  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  39.74 
 
 
228 aa  157  9e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  38.67 
 
 
229 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  39.92 
 
 
259 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  36.56 
 
 
224 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  39.92 
 
 
285 aa  156  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  37 
 
 
224 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  39.74 
 
 
228 aa  156  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  40.61 
 
 
226 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  38.77 
 
 
224 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  37.84 
 
 
226 aa  155  4e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  35.96 
 
 
224 aa  155  5e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  41.3 
 
 
237 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  38.6 
 
 
228 aa  155  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  38.43 
 
 
225 aa  154  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  40.09 
 
 
223 aa  154  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.26628e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  36.24 
 
 
227 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  37.61 
 
 
230 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  38.33 
 
 
223 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  42.08 
 
 
224 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  37 
 
 
229 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  37 
 
 
229 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  38.5 
 
 
227 aa  152  3e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  39.46 
 
 
484 aa  152  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  39.21 
 
 
234 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  37.39 
 
 
231 aa  151  6e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  40.69 
 
 
237 aa  152  6e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  38.77 
 
 
234 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  37.17 
 
 
235 aa  151  8e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  38.77 
 
 
234 aa  151  9e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  37.55 
 
 
244 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  37.67 
 
 
236 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  41.48 
 
 
230 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  38.36 
 
 
229 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  40.76 
 
 
224 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  36.56 
 
 
233 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  38.5 
 
 
228 aa  148  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  39.56 
 
 
230 aa  147  9e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  40.55 
 
 
224 aa  147  1e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  40.55 
 
 
224 aa  147  2e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  38.89 
 
 
256 aa  146  2e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  39.56 
 
 
230 aa  147  2e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  6.96721e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  35.29 
 
 
229 aa  146  2e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  36.73 
 
 
229 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  34.36 
 
 
227 aa  145  4e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>