211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0011 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  100 
 
 
183 aa  373  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  100 
 
 
183 aa  373  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  99.45 
 
 
183 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  91.26 
 
 
215 aa  349  1e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  77.05 
 
 
216 aa  298  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.15937e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  74.32 
 
 
214 aa  287  7e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  2.89321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  65.22 
 
 
215 aa  248  4e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  47.75 
 
 
179 aa  154  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  46.28 
 
 
191 aa  150  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  44.94 
 
 
179 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  47.34 
 
 
392 aa  143  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  41.49 
 
 
191 aa  143  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  1.1253e-05 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  42.11 
 
 
197 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  46.78 
 
 
178 aa  141  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  41.62 
 
 
190 aa  140  1e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  45.61 
 
 
178 aa  140  1e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  42.78 
 
 
178 aa  139  2e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  44.39 
 
 
192 aa  139  2e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  42.11 
 
 
191 aa  139  2e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  44.02 
 
 
191 aa  139  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  40.72 
 
 
191 aa  137  8e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  41.88 
 
 
190 aa  137  9e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  43.18 
 
 
188 aa  136  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  40.11 
 
 
194 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  40.72 
 
 
191 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  39.04 
 
 
194 aa  135  3e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  44.38 
 
 
179 aa  134  7e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  44.38 
 
 
179 aa  134  7e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  39.04 
 
 
194 aa  134  9e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  42.86 
 
 
191 aa  133  1e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  8.75235e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  39.47 
 
 
191 aa  134  1e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  40.64 
 
 
192 aa  134  1e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  41.3 
 
 
191 aa  132  2e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  6.72055e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  41.76 
 
 
190 aa  132  2e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  45.56 
 
 
177 aa  132  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.07911e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  43.5 
 
 
178 aa  132  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  41.4 
 
 
190 aa  132  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  44.07 
 
 
178 aa  131  4e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  43.2 
 
 
179 aa  132  4e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  43.79 
 
 
180 aa  130  8e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  42.53 
 
 
181 aa  130  9e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  1.48271e-09  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  44.38 
 
 
179 aa  130  1e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  40.91 
 
 
190 aa  130  1e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  44.38 
 
 
221 aa  130  1e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.56435e-05  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  39.18 
 
 
191 aa  129  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  3.77128e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  44.38 
 
 
179 aa  128  4e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  38.14 
 
 
191 aa  127  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  38.3 
 
 
195 aa  128  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  39.57 
 
 
194 aa  127  1e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  37.77 
 
 
195 aa  126  2e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  41.42 
 
 
696 aa  126  2e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  37.97 
 
 
195 aa  126  2e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  42.77 
 
 
190 aa  125  2e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  41.21 
 
 
191 aa  126  2e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  43.02 
 
 
233 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  42.01 
 
 
696 aa  125  4e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  46.15 
 
 
177 aa  125  4e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  37.77 
 
 
191 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  6.54398e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  34.21 
 
 
194 aa  123  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  40.21 
 
 
192 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  40.45 
 
 
178 aa  121  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  40.45 
 
 
178 aa  121  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  40.98 
 
 
196 aa  121  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  41.42 
 
 
179 aa  120  9e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  40.86 
 
 
191 aa  120  1e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  43.11 
 
 
172 aa  119  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  45.83 
 
 
165 aa  116  1e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  39.01 
 
 
194 aa  116  2e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.4183e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  44.64 
 
 
165 aa  114  7e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  43.86 
 
 
167 aa  110  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.70126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  44.05 
 
 
165 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  38.17 
 
 
192 aa  108  4e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  36.81 
 
 
196 aa  107  9e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  36.07 
 
 
185 aa  104  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  35.91 
 
 
263 aa  103  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  34.97 
 
 
185 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  41.52 
 
 
165 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  3.83486e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  40.12 
 
 
165 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  36.14 
 
 
164 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  9.58071e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  38.82 
 
 
173 aa  101  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  42.26 
 
 
164 aa  98.2  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  38.1 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  40.61 
 
 
165 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  38.24 
 
 
166 aa  96.7  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  39.88 
 
 
164 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  40.48 
 
 
165 aa  95.9  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  38.51 
 
 
166 aa  94.4  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  40.12 
 
 
168 aa  94  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  40.37 
 
 
166 aa  94  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  39.41 
 
 
164 aa  94  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.60498e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  40.74 
 
 
166 aa  93.2  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  37.57 
 
 
164 aa  93.2  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  41.46 
 
 
166 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  37.13 
 
 
166 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  38.73 
 
 
164 aa  93.2  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  38.32 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  36.84 
 
 
163 aa  91.7  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  35.58 
 
 
168 aa  91.7  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  42.75 
 
 
146 aa  90.5  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  32.97 
 
 
184 aa  90.1  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>