More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0009 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0036  ribonuclease HII  100 
 
 
191 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00659063  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0009  ribonuclease HII  100 
 
 
191 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  96.86 
 
 
191 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0083  ribonuclease HII  63.58 
 
 
183 aa  214  8e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0280  ribonuclease HII  58.29 
 
 
188 aa  198  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.259622  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  58.52 
 
 
185 aa  198  4e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  58.48 
 
 
184 aa  195  3e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  53.76 
 
 
183 aa  181  7e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1971  Ribonuclease H  50.87 
 
 
182 aa  176  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0578493  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  49.72 
 
 
189 aa  164  8e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  42.41 
 
 
206 aa  130  1e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.38708e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  38.42 
 
 
197 aa  126  2e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  43.82 
 
 
202 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  43.82 
 
 
202 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  39.2 
 
 
256 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  41.62 
 
 
242 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  39.66 
 
 
216 aa  121  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  38.25 
 
 
245 aa  121  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  35.96 
 
 
307 aa  120  1e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  38.1 
 
 
208 aa  119  4e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  37.11 
 
 
210 aa  118  5e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  36.72 
 
 
228 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  38.59 
 
 
213 aa  117  1e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  39.55 
 
 
204 aa  117  1e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  39.67 
 
 
191 aa  115  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  39.89 
 
 
279 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  39.43 
 
 
277 aa  115  4e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  35.44 
 
 
229 aa  115  4e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  36.16 
 
 
262 aa  115  4e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  7.06526e-06  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  39.13 
 
 
191 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  37.29 
 
 
230 aa  114  7e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  38.86 
 
 
198 aa  114  7e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  2.94513e-05 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  39.8 
 
 
203 aa  114  8e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  38.27 
 
 
234 aa  114  8e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  40.56 
 
 
207 aa  114  8e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1068  ribonuclease HII  37.57 
 
 
195 aa  113  1e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  38.29 
 
 
214 aa  114  1e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  38.25 
 
 
210 aa  114  1e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  38.27 
 
 
234 aa  114  1e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19431  ribonuclease HII  37.57 
 
 
195 aa  113  2e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  38.12 
 
 
253 aa  113  2e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  37.99 
 
 
236 aa  112  2e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  38.74 
 
 
207 aa  113  2e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  37.57 
 
 
249 aa  113  2e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  37.71 
 
 
214 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  37.71 
 
 
214 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  37.71 
 
 
214 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6711  predicted protein  35.83 
 
 
189 aa  112  4e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00445618  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  35.75 
 
 
217 aa  112  5e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  42.37 
 
 
203 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  36.96 
 
 
197 aa  111  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  35.39 
 
 
229 aa  111  8e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10050  ribonuclease HII  34.38 
 
 
272 aa  111  8e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  36.78 
 
 
241 aa  111  8e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  35.44 
 
 
229 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  37.64 
 
 
264 aa  110  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  38.86 
 
 
257 aa  110  1e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  37.99 
 
 
232 aa  109  2e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  40.93 
 
 
198 aa  109  2e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  36.26 
 
 
210 aa  109  2e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  36.57 
 
 
217 aa  110  2e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  36.57 
 
 
217 aa  110  2e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13470  predicted protein  31.96 
 
 
194 aa  108  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  37.43 
 
 
232 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  36.31 
 
 
198 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  39.89 
 
 
257 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0045  ribonuclease HII  38.2 
 
 
181 aa  109  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  38.33 
 
 
216 aa  108  4e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  37.91 
 
 
255 aa  108  4e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  35.96 
 
 
239 aa  108  4e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  38.2 
 
 
197 aa  108  4e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  35.96 
 
 
239 aa  108  4e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  36.46 
 
 
214 aa  108  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  36.96 
 
 
206 aa  108  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  6.92909e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  37.5 
 
 
198 aa  108  6e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  38.8 
 
 
218 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  39.33 
 
 
209 aa  107  9e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.29039e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  36.52 
 
 
275 aa  107  9e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  39.44 
 
 
212 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  38.2 
 
 
193 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  33.5 
 
 
211 aa  106  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  37.57 
 
 
214 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  4.28257e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2476  ribonuclease HII  34.98 
 
 
221 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0918976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  39.67 
 
 
213 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1632  Ribonuclease H  38.89 
 
 
228 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0189  Ribonuclease H  37.77 
 
 
197 aa  106  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.682381  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0912  ribonuclease HII  33.95 
 
 
287 aa  106  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.976691 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  35.29 
 
 
212 aa  106  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  35.39 
 
 
239 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  37.04 
 
 
206 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  40.78 
 
 
208 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  36.56 
 
 
201 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  38.2 
 
 
198 aa  105  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  40.11 
 
 
190 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  37.57 
 
 
198 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  39.11 
 
 
198 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  41.08 
 
 
199 aa  105  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  36.16 
 
 
255 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  37.22 
 
 
248 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  36.21 
 
 
199 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>