More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0008 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0009  glutamate synthase subunit beta  96.26 
 
 
481 aa  954  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  2.90195e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0035  glutamate synthase subunit beta  96.67 
 
 
481 aa  961  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0133705  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0008  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 
481 aa  985  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0185  glutamate synthase subunit beta  51.37 
 
 
491 aa  496  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0629  glutamate synthase subunit beta  51.16 
 
 
491 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0673  glutamate synthase subunit beta  51.16 
 
 
491 aa  482  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0503  glutamate synthase subunit beta  50.21 
 
 
492 aa  483  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114994  normal  0.266316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  49.79 
 
 
491 aa  484  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  49.18 
 
 
493 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0782  glutamate synthase subunit beta  48.64 
 
 
491 aa  476  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50 
 
 
489 aa  474  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1795  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.39 
 
 
506 aa  472  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  49.89 
 
 
490 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1936  glutamate synthase subunit beta  50.53 
 
 
491 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  46.93 
 
 
495 aa  469  1e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.46 
 
 
494 aa  469  1e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2225  glutamate synthase subunit beta  50 
 
 
494 aa  469  1e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.52 
 
 
495 aa  467  1e-130  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3757  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.06 
 
 
494 aa  465  1e-130  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.44746e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.52 
 
 
495 aa  466  1e-130  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.13 
 
 
495 aa  467  1e-130  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3015  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49.27 
 
 
493 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0895  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.82 
 
 
461 aa  462  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0947  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.75 
 
 
505 aa  462  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20342  synthase of glutamate synthase  46.77 
 
 
580 aa  446  1e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0762  glutamate synthase subunit beta  47.76 
 
 
496 aa  441  1e-122  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2867  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  47.37 
 
 
493 aa  441  1e-122  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1349  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  46.95 
 
 
493 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.28565e-07 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0109  glutamate synthase subunit beta  44.9 
 
 
487 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  44.96 
 
 
2135 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0507  glutamate synthase subunit beta  44.31 
 
 
487 aa  416  1e-115  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.4 
 
 
492 aa  415  1e-115  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0494  glutamate synthase subunit beta  44.31 
 
 
487 aa  416  1e-115  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0118721  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.89 
 
 
489 aa  418  1e-115  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1406  glutamate synthase subunit beta  44.29 
 
 
479 aa  411  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05134  Glutamate synthase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8F4]  44.38 
 
 
2126 aa  409  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  45.59 
 
 
484 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  41.8 
 
 
479 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87428  glutamate synthase  44.38 
 
 
2126 aa  401  1e-110  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  42.42 
 
 
482 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  43.53 
 
 
489 aa  391  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  42.3 
 
 
480 aa  392  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  43.12 
 
 
496 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  42.51 
 
 
489 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  42.54 
 
 
489 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  42.83 
 
 
471 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  42.71 
 
 
487 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  43.56 
 
 
500 aa  385  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  42.51 
 
 
487 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  41.43 
 
 
495 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  42.97 
 
 
502 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  40.37 
 
 
478 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  39.39 
 
 
488 aa  376  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  42.52 
 
 
488 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  43.85 
 
 
491 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  1.32905e-07 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  41.42 
 
 
492 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  42.31 
 
 
487 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  42.52 
 
 
488 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  41.32 
 
 
488 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  41.91 
 
 
472 aa  378  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  42.32 
 
 
490 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  40.79 
 
 
492 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  42.86 
 
 
489 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  40.93 
 
 
485 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  41.3 
 
 
487 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  42.66 
 
 
489 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  3.56893e-06 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  41.12 
 
 
488 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  40.87 
 
 
472 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  40.79 
 
 
492 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  41.27 
 
 
485 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  41.63 
 
 
484 aa  370  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  41.51 
 
 
484 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  40.95 
 
 
485 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  42.45 
 
 
484 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  41.12 
 
 
488 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  41.07 
 
 
491 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  40.52 
 
 
488 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  42.17 
 
 
487 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  41.1 
 
 
484 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  40.67 
 
 
491 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  40.85 
 
 
494 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  41.31 
 
 
486 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  42.02 
 
 
491 aa  365  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  43.2 
 
 
505 aa  365  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  41.22 
 
 
484 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  42.11 
 
 
487 aa  363  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  41.35 
 
 
489 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0819  glutamate synthase subunit beta  42.83 
 
 
484 aa  363  3e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  41.35 
 
 
489 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  40.33 
 
 
487 aa  362  6e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.68893e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  41.86 
 
 
488 aa  361  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  40.51 
 
 
493 aa  361  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  40.61 
 
 
488 aa  360  4e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  40.88 
 
 
492 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  43 
 
 
488 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  43 
 
 
488 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  41.68 
 
 
488 aa  358  1e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0609  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  40.54 
 
 
492 aa  358  1e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0291397  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  43 
 
 
488 aa  358  1e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  43 
 
 
488 aa  358  1e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>