More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0007 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0842  Glutamate synthase (ferredoxin)  47.19 
 
 
1560 aa  1361  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.237024  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  46.7 
 
 
1577 aa  1376  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03319  glutamate synthase subunit alpha  40.56 
 
 
1462 aa  1045  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.645921  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3243  Glutamate synthase (ferredoxin)  47.55 
 
 
1599 aa  1375  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3591  Glutamate synthase (ferredoxin)  47.16 
 
 
1567 aa  1386  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213312  hitchhiker  2.78043e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3558  glutamate synthase subunit alpha  42.66 
 
 
1486 aa  1147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1253  Glutamate synthase (ferredoxin)  46.12 
 
 
1479 aa  1294  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2788  glutamate synthase (ferredoxin)  46.97 
 
 
1567 aa  1380  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395907  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3031  glutamate synthase (ferredoxin)  47.11 
 
 
1553 aa  1394  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2166  glutamate synthase subunit alpha  40.73 
 
 
1489 aa  1061  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0894  glutamate synthase (ferredoxin)  51.69 
 
 
1528 aa  1543  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.08401  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0330  glutamate synthase (ferredoxin)  46.9 
 
 
1567 aa  1388  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3396  glutamate synthase (ferredoxin)  45.91 
 
 
1588 aa  1344  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2258  glutamate synthase subunit alpha  40.87 
 
 
1477 aa  1069  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0454247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  46.27 
 
 
1564 aa  1372  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0381  glutamate synthase (ferredoxin)  47.03 
 
 
1567 aa  1390  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  43.11 
 
 
1482 aa  1177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  45.24 
 
 
1468 aa  1208  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1937  Glutamate synthase (ferredoxin)  50.33 
 
 
1533 aa  1516  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3317  Glutamate synthase (ferredoxin)  46.25 
 
 
1574 aa  1358  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0330  Glutamate synthase (ferredoxin)  41.2 
 
 
1513 aa  1108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.954616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4535  glutamate synthase subunit alpha  42.65 
 
 
1517 aa  1146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  48.02 
 
 
1515 aa  1422  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.19 
 
 
1475 aa  1134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2866  ferredoxin-dependent glutamate synthase  52.67 
 
 
1527 aa  1567  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0865  Glutamate synthase (ferredoxin)  50.69 
 
 
1536 aa  1548  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01631  glutamate synthase subunit alpha  42.32 
 
 
1460 aa  1135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.65 
 
 
1469 aa  1144  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  39.95 
 
 
1484 aa  1053  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0781  Glutamate synthase (ferredoxin)  50.1 
 
 
1533 aa  1504  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251608  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0612  Glutamate synthase (ferredoxin)  50.46 
 
 
1539 aa  1532  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  46.59 
 
 
1575 aa  1372  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0672  Glutamate synthase (ferredoxin)  50.52 
 
 
1534 aa  1491  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0567  glutamate synthase  47.53 
 
 
1523 aa  1377  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3016  Glutamate synthase (ferredoxin)  52.28 
 
 
1524 aa  1536  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  45.09 
 
 
1571 aa  1355  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0390  glutamate synthase subunit alpha  41.06 
 
 
1481 aa  1112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  43.41 
 
 
1482 aa  1171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3700  glutamate synthase subunit alpha  42.59 
 
 
1486 aa  1145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3405  glutamate synthase subunit alpha  42.66 
 
 
1486 aa  1148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  48.53 
 
 
1516 aa  1432  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  41.72 
 
 
1487 aa  1148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1903  glutamate synthase (ferredoxin)  43.79 
 
 
1546 aa  1258  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0477  glutamate synthase (ferredoxin)  46.48 
 
 
1567 aa  1382  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0794035  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1964  glutamate synthase (ferredoxin)  47.16 
 
 
1580 aa  1406  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.321687  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  42.73 
 
 
1485 aa  1174  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0007  glutamate synthase, large subunit  99.4 
 
 
1495 aa  3056  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  7.81352e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0854  glutamate synthase (ferredoxin)  50.87 
 
 
1540 aa  1545  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.265918  normal  0.188488 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  46.12 
 
 
1583 aa  1379  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  42.78 
 
 
1462 aa  1140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  47.29 
 
 
1536 aa  1403  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5773  glutamate synthase subunit alpha  41.87 
 
 
1481 aa  1131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4114  glutamate synthase subunit alpha  41.75 
 
 
1461 aa  1115  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  7.85816e-06 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  42.39 
 
 
1486 aa  1177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  42.53 
 
 
1482 aa  1169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3508  glutamate synthase subunit alpha  42.54 
 
 
1517 aa  1145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0488  glutamate synthase subunit alpha  42.6 
 
 
1522 aa  1148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.690727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  42.8 
 
 
1485 aa  1176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4950  glutamate synthase (ferredoxin)  41.44 
 
 
1509 aa  1115  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544718  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5126  glutamate synthase subunit alpha  41.11 
 
 
1481 aa  1112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.979784  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  46.14 
 
 
1572 aa  1369  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  42.71 
 
 
1535 aa  1176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0305  glutamate synthase (ferredoxin)  47.3 
 
 
1629 aa  1388  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  53.85 
 
 
1526 aa  1591  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5558  glutamate synthase (ferredoxin)  46.04 
 
 
1576 aa  1377  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  0.943679 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  42.78 
 
 
1462 aa  1142  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  43.84 
 
 
1531 aa  1137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4476  glutamate synthase (ferredoxin)  43.83 
 
 
1485 aa  1216  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.4617  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3392  glutamate synthase (ferredoxin)  47.4 
 
 
1573 aa  1395  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140054  normal  0.116852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0002  glutamate synthase  42.96 
 
 
1512 aa  1151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1935  glutamate synthase (ferredoxin)  47.49 
 
 
1548 aa  1433  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891386  normal  0.412086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  46.25 
 
 
1574 aa  1351  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  42.75 
 
 
1482 aa  1164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3166  Glutamate synthase (ferredoxin)  48.99 
 
 
1516 aa  1438  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.563815  normal  0.707717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  47.47 
 
 
1511 aa  1422  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  42.41 
 
 
1487 aa  1160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  48.73 
 
 
1516 aa  1434  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2942  Glutamate synthase (ferredoxin)  46.86 
 
 
1524 aa  1373  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290675  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0118  Glutamate synthase (ferredoxin)  48.14 
 
 
1537 aa  1441  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.750611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6714  Glutamate synthase (ferredoxin)  48.22 
 
 
1526 aa  1394  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  44.23 
 
 
1486 aa  1230  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  42.98 
 
 
1486 aa  1178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  52.25 
 
 
1519 aa  1581  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3072  Glutamate synthase (ferredoxin)  46.06 
 
 
1527 aa  1339  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191791  hitchhiker  0.00286701 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3758  Glutamate synthase (ferredoxin)  52.95 
 
 
1521 aa  1611  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00101986  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3135  Glutamate synthase (ferredoxin)  45.17 
 
 
1527 aa  1306  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815016  normal  0.26832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  47.24 
 
 
1525 aa  1405  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  43.48 
 
 
1571 aa  1188  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  43.58 
 
 
1554 aa  1196  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  47.78 
 
 
1527 aa  1410  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2866  Glutamate synthase (ferredoxin)  50.64 
 
 
1519 aa  1486  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166773  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.06 
 
 
1474 aa  1107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  50.57 
 
 
1508 aa  1473  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0107  Glutamate synthase (ferredoxin)  48.54 
 
 
1535 aa  1440  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  48.18 
 
 
1521 aa  1405  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2694  Glutamate synthase (NADH)  46.96 
 
 
1569 aa  1380  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  47.78 
 
 
1502 aa  1392  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2529  Glutamate synthase (ferredoxin)  45.02 
 
 
1536 aa  1281  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.455706  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  42.61 
 
 
1487 aa  1178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3213  Glutamate synthase (ferredoxin)  47.16 
 
 
1542 aa  1412  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>