73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0006 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  100 
 
 
433 aa  856  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  99.31 
 
 
433 aa  852  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  97.92 
 
 
433 aa  798  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  74.55 
 
 
450 aa  598  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  54.51 
 
 
455 aa  475  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  53.23 
 
 
432 aa  474  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  55.05 
 
 
435 aa  468  1e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  53.85 
 
 
455 aa  431  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  49.19 
 
 
433 aa  402  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  1.24721e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  49.42 
 
 
434 aa  391  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  45.06 
 
 
446 aa  385  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8202e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  45.23 
 
 
440 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  42.82 
 
 
439 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  44.75 
 
 
439 aa  363  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  5.63518e-05  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  46.36 
 
 
441 aa  361  1e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.34794e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  42.6 
 
 
439 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  44.57 
 
 
452 aa  360  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  42.37 
 
 
439 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  42.37 
 
 
439 aa  360  4e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  42.37 
 
 
439 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  44.87 
 
 
439 aa  358  7e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  7.23865e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  42.37 
 
 
439 aa  356  6e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  42.14 
 
 
439 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  42.37 
 
 
439 aa  353  3e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  44.52 
 
 
439 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.75833e-07  hitchhiker  3.05197e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  44.52 
 
 
439 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  7.45905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  44.52 
 
 
439 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  44.52 
 
 
439 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.26474e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  42.37 
 
 
439 aa  352  6e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  42.37 
 
 
439 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  44.32 
 
 
431 aa  350  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  46.12 
 
 
439 aa  349  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  4.44326e-05  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  46.58 
 
 
439 aa  349  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.29445e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  44.82 
 
 
446 aa  349  6e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  44.79 
 
 
453 aa  348  8e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  42.14 
 
 
439 aa  348  9e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  44.98 
 
 
439 aa  346  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  44.75 
 
 
439 aa  345  7e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  45.05 
 
 
425 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.04263e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  45.23 
 
 
439 aa  345  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  44.44 
 
 
439 aa  344  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.51079e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  45.07 
 
 
442 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  45 
 
 
439 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.74807e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  44.59 
 
 
445 aa  340  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.44395e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  42.63 
 
 
442 aa  337  2e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  41 
 
 
440 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  41.36 
 
 
464 aa  330  4e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  40.14 
 
 
438 aa  327  2e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.34758e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  40.14 
 
 
438 aa  327  2e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  8.51242e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  39.91 
 
 
438 aa  325  8e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  41.52 
 
 
448 aa  323  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  45.91 
 
 
440 aa  307  3e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  42.73 
 
 
441 aa  304  2e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  42.73 
 
 
441 aa  304  2e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  41.67 
 
 
439 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  42.37 
 
 
439 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  41.89 
 
 
439 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  42.37 
 
 
439 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  42.14 
 
 
438 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  37.19 
 
 
448 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  41.36 
 
 
439 aa  275  1e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  34.84 
 
 
438 aa  275  1e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  22.3 
 
 
507 aa  53.1  9e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  29.11 
 
 
510 aa  51.6  3e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  29.75 
 
 
457 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0853  putative permease protein  20.32 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0845  GntP family permease  20.32 
 
 
419 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00379452  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  27.04 
 
 
515 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  26.23 
 
 
521 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.86366e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  28.57 
 
 
557 aa  45.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  28.57 
 
 
493 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2104  gluconate transporter  23.4 
 
 
455 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  26.81 
 
 
517 aa  44.3  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>