59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_tTyr01 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_tTyr01  tRNA-Tyr  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0019  tRNA-Tyr  90.28 
 
 		 83 bp  87.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00432304  decreased coverage  0.00738157 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0010  tRNA-Tyr  93.1 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000473639  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2231  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000893857  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1328  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.044502  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2193  tRNA-Tyr  91.67 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000544393  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna4  tRNA-Tyr  87.69 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07723  tRNA-Tyr  90.16 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0015  tRNA-Tyr  87.69 
 
 		 86 bp  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000666826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0027  tRNA-Tyr  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.645758  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0054  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000756603  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0054  tRNA-Tyr  94.87 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000219013  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0015  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0056  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00201285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0045  tRNA-Tyr  91.11 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000472337  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0053  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.122599  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0058  tRNA-Tyr  87.5 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.401108  normal  0.738165 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  90.2 
 
 		 82 bp  54  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0050  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563652  normal  0.998749 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0026  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 82 bp  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2436  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0042  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0072  tRNA-Tyr  94.12 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2151  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2438  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2441  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2148  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2146  tRNA-Tyr  85.48 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0001  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232487  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0016  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000723443  decreased coverage  0.0000959662 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0011  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000214053  hitchhiker  0.00323075 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0024  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0015  tRNA-Tyr  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0004  tRNA-Tyr  88.89 
 
 		 83 bp  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216119  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Tyr-1  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.63004  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0045  tRNA-Tyr  90 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0437  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 83 bp  48.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000000253794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0023  tRNA-Tyr  90 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000432297  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1717  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000393409  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1468  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 86 bp  48.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000829322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0077  tRNA-Tyr  91.43 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t012  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000011091  hitchhiker  0.000000000474372 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0090  tRNA-Tyr  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00740419 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0357  tRNA-Tyr  89.47 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.189784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0106  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000012042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0020  tRNA-Tyr  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0109  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000000980988  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0110  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000374074  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0114  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000001247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t015  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000513165  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0127  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000119757  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t011  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894711  hitchhiker  0.000000000511472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0117  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121705  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0118  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119427  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1675  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000825492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0123  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00201303  hitchhiker  0.000458839 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0051  tRNA-Tyr  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0589159  unclonable  6.439e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0020  tRNA-Tyr  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000168001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0126  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000574735  hitchhiker  0.000475318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>