More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3777 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  69 
 
 		 502 aa  726    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  66.87 
 
 		 491 aa  691    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  72.58 
 
 		 496 aa  746    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  61.9 
 
 		 489 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 500 aa  1037    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  62.7 
 
 		 489 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  62.3 
 
 		 489 aa  641    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  62.6 
 
 		 488 aa  632  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  60.28 
 
 		 490 aa  634  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  58.06 
 
 		 489 aa  593  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  58.63 
 
 		 484 aa  588  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.49 
 
 		 482 aa  582  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  57.59 
 
 		 471 aa  578  1e-164  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  57.94 
 
 		 487 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  55.94 
 
 		 479 aa  571  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  56.75 
 
 		 487 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  55.94 
 
 		 478 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  56.55 
 
 		 487 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  57.79 
 
 		 491 aa  559  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  56.69 
 
 		 492 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  55.84 
 
 		 489 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  55.95 
 
 		 488 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  55.84 
 
 		 489 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  55.75 
 
 		 487 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  55.95 
 
 		 488 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  57.34 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 488 aa  555  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  56.55 
 
 		 488 aa  552  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  56.15 
 
 		 488 aa  554  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  57.14 
 
 		 487 aa  548  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.51 
 
 		 485 aa  550  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  54.1 
 
 		 480 aa  549  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.85 
 
 		 487 aa  551  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.33 
 
 		 492 aa  548  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  55.33 
 
 		 472 aa  545  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  56.1 
 
 		 492 aa  545  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  55.17 
 
 		 492 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  56.15 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  53.94 
 
 		 488 aa  544  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  56.15 
 
 		 488 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  55.1 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1936  glutamate synthase subunit beta  53.24 
 
 		 481 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336215  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.34 
 
 		 495 aa  538  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  55.1 
 
 		 489 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  54.21 
 
 		 480 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  54.83 
 
 		 491 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.18 
 
 		 484 aa  535  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2693  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.35 
 
 		 489 aa  538  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207302  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3656  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.74 
 
 		 494 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  54.53 
 
 		 492 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  55.36 
 
 		 488 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3746  glutamate synthase subunit beta  55.36 
 
 		 488 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0866  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.53 
 
 		 495 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.27 
 
 		 488 aa  532  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2735  glutamate synthase subunit beta  55.16 
 
 		 488 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2786  glutamate synthase subunit beta  55.16 
 
 		 488 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.24 
 
 		 488 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  55.36 
 
 		 488 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1768  glutamate synthase subunit beta  55.16 
 
 		 488 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1459  glutamate synthase, NADH/NADPH small subunit  51.9 
 
 		 494 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.1665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  55.56 
 
 		 488 aa  533  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.3 
 
 		 492 aa  531  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  55.36 
 
 		 488 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  55.16 
 
 		 488 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  55.36 
 
 		 488 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.69 
 
 		 484 aa  534  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  55.36 
 
 		 488 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.7 
 
 		 495 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3217  glutamate synthase subunit beta  55.16 
 
 		 506 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0870  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  54.33 
 
 		 495 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  55.12 
 
 		 472 aa  531  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3021  glutamate synthase subunit beta  52.01 
 
 		 493 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0349235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0855  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.12 
 
 		 495 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.554857  normal  0.298305 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0818  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.92 
 
 		 495 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  56.56 
 
 		 477 aa  527  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  54.78 
 
 		 485 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  53.49 
 
 		 484 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  55.95 
 
 		 487 aa  527  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  54.29 
 
 		 488 aa  527  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.63 
 
 		 482 aa  523  1e-147  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0095  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.56 
 
 		 487 aa  524  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.440417  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0473  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.62 
 
 		 489 aa  522  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  53.19 
 
 		 484 aa  523  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  53.46 
 
 		 491 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  52.1 
 
 		 484 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  53.29 
 
 		 484 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  53.27 
 
 		 488 aa  519  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0613  glutamate synthase subunit beta  52.28 
 
 		 491 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0742  glutamate synthase subunit beta  55.31 
 
 		 492 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  50.51 
 
 		 486 aa  514  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  52.5 
 
 		 484 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  53.47 
 
 		 488 aa  514  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0710  glutamate synthase subunit beta  55.12 
 
 		 492 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.893657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1963  glutamate synthase subunit beta  53.07 
 
 		 473 aa  508  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  51.84 
 
 		 485 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2804  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  50.2 
 
 		 490 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1347  glutamate synthase subunit beta  50.5 
 
 		 493 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1370  glutamate synthase subunit beta  54.11 
 
 		 482 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0895  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.2 
 
 		 461 aa  501  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.302268 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1079  glutamate synthase (NADH) small subunit  51.41 
 
 		 486 aa  498  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>