213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3757 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  100 
 
 		 459 aa  934    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  39.44 
 
 		 381 aa  290  5.0000000000000004e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  32.24 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.94 
 
 		 369 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  34.27 
 
 		 425 aa  200  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.26 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  29.39 
 
 		 410 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  31.36 
 
 		 482 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  30.91 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  28.33 
 
 		 388 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.86 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.35 
 
 		 385 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  26.98 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  29.86 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  27.62 
 
 		 406 aa  154  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  35.17 
 
 		 1117 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  27.52 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.17 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  28.94 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  27.55 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  28.64 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.48 
 
 		 850 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.2 
 
 		 849 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  30.91 
 
 		 388 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.74 
 
 		 850 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  24.94 
 
 		 783 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.76 
 
 		 842 aa  127  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.79 
 
 		 851 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.16 
 
 		 843 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  25.12 
 
 		 850 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  25.35 
 
 		 840 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07035  putative iron-regulated transmembrane protein  26.74 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  31.25 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  25.83 
 
 		 850 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  29.07 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  24.04 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  22.32 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  23.91 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4883  hypothetical protein  23.83 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  26.2 
 
 		 822 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0714  hypothetical protein  28.72 
 
 		 362 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0335793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  23.1 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.52 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  26.41 
 
 		 380 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  26.41 
 
 		 380 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  25.06 
 
 		 388 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.14 
 
 		 885 aa  96.3  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  27.59 
 
 		 374 aa  96.3  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  21.84 
 
 		 405 aa  93.6  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  26.8 
 
 		 372 aa  92.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.65 
 
 		 844 aa  92.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  22.76 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.66 
 
 		 409 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  26.67 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.38 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.58 
 
 		 849 aa  86.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.3 
 
 		 840 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4916  PepSY-associated TM helix domain protein  29.15 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  24.23 
 
 		 844 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  21.5 
 
 		 411 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  21.67 
 
 		 403 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  20.63 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  22.4 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  25.87 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.02 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  22.4 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3923  hypothetical protein  20.61 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.810818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  22.17 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  23.26 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3413  hypothetical protein  23.64 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  22.32 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  22.2 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.4 
 
 		 892 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0337  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.76 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5168  PepSY-associated TM helix domain protein  20.48 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  20.97 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  20.51 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2403  PepSY-associated TM helix  20.41 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2016  PepSY-associated TM helix family protein  21.63 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00288913  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.27 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.8 
 
 		 539 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2122  PepSY-associated TM helix domain protein  24.15 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000205192  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4775  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.56 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.15009  normal  0.939836 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3482  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.12 
 
 		 525 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.700235  hitchhiker  0.00378927 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  21.51 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  22.12 
 
 		 534 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  22.15 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  27.8 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  19.55 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.08 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0909277  normal  0.103498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5242  PepSY-associated TM helix domain protein  20.34 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.816011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  22.4 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  20.99 
 
 		 575 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  18.82 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  19.35 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0120  PepSY-associated TM helix  19.74 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1899  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.75 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.315417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2196  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00896823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2548  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.02 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.023404  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1842  peptidase  21.68 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000009983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>