More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3755 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  48.12 
 
 		 772 aa  707    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  100 
 
 		 799 aa  1639    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  54.43 
 
 		 791 aa  906    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  52.96 
 
 		 797 aa  827    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  40.52 
 
 		 782 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  37.53 
 
 		 798 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  39.42 
 
 		 713 aa  486  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 792 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1117 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3315  TonB-dependent receptor, plug  28.61 
 
 		 781 aa  311  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1669  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 823 aa  293  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.306127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  29.19 
 
 		 788 aa  283  9e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  27.17 
 
 		 767 aa  280  6e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 763 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  26.08 
 
 		 960 aa  258  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  30.81 
 
 		 848 aa  108  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 760 aa  104  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  27.78 
 
 		 833 aa  102  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 795 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 750 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  30.25 
 
 		 747 aa  93.6  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 833 aa  91.7  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 748 aa  90.9  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 778 aa  90.9  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 763 aa  88.6  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  23.14 
 
 		 753 aa  87.8  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 776 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 1004 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 1047 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 828 aa  84  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 932 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 793 aa  82  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 781 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 943 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 845 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1040 aa  79  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 917 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 653 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 769 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 649 aa  77  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 924 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 783 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1148 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  28.36 
 
 		 647 aa  77  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 933 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 649 aa  75.5  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  26.37 
 
 		 785 aa  75.1  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 882 aa  75.1  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 789 aa  75.1  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 874 aa  74.7  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 866 aa  74.7  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  27.08 
 
 		 808 aa  73.9  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  37.39 
 
 		 620 aa  73.9  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 794 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 824 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 759 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 664 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 668 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 666 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 767 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 697 aa  73.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 757 aa  72.4  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1066 aa  72  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0350  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 651 aa  71.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513607  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1060 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 854 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  31.22 
 
 		 659 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 836 aa  70.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1040 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 933 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 		 907 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7219  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 698 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 782 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 814 aa  68.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 		 653 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 988 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1068 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5681  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 786 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0807191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  20 
 
 		 721 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1202 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  31.33 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 621 aa  68.2  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 812 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1076 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 1089 aa  68.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.02 
 
 		 1062 aa  67.8  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  31.33 
 
 		 653 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 946 aa  67.8  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 806 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  27.43 
 
 		 800 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  26.52 
 
 		 811 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  29.81 
 
 		 617 aa  67  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1175 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 597 aa  67  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1021 aa  67.4  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1161 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.47 
 
 		 631 aa  66.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 919 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>