More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3684 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3684  hemolysin-like protein  100 
 
 
293 aa  594  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335201  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  46 
 
 
431 aa  238  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4440  CBS domain containing protein  46.81 
 
 
438 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  44.49 
 
 
418 aa  231  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  42.96 
 
 
419 aa  228  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  42.91 
 
 
431 aa  219  3.9999999999999997e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0935  CBS domain containing protein  40.08 
 
 
464 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5985  gliding motility-associated protein GldE  46.4 
 
 
453 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  39.04 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  36.73 
 
 
434 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  36.81 
 
 
284 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  37.28 
 
 
447 aa  173  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  34.39 
 
 
425 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  36.78 
 
 
296 aa  168  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 
291 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  34.13 
 
 
287 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  39.51 
 
 
434 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  37.5 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  37.1 
 
 
291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  33.79 
 
 
287 aa  165  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.73 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  36.69 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  36.69 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3902  CBS domain containing protein  33.6 
 
 
425 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  34.24 
 
 
284 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3980  CBS domain containing protein  33.6 
 
 
425 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  35.29 
 
 
427 aa  162  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  37.29 
 
 
435 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  35.5 
 
 
447 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  34.44 
 
 
417 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  33.9 
 
 
258 aa  160  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  37.82 
 
 
285 aa  159  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  35.95 
 
 
434 aa  158  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
284 aa  158  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  36.25 
 
 
286 aa  158  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  37.79 
 
 
439 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  34.31 
 
 
420 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
428 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  37.99 
 
 
285 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  35.22 
 
 
291 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.69 
 
 
292 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  36.13 
 
 
443 aa  156  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  37.18 
 
 
422 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  34.02 
 
 
323 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  34.01 
 
 
292 aa  155  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  35.27 
 
 
293 aa  155  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  39.61 
 
 
250 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  34.15 
 
 
433 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.62 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  35.22 
 
 
291 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
323 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  35.16 
 
 
446 aa  153  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  34.98 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  37.02 
 
 
285 aa  152  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  34.8 
 
 
423 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  33.2 
 
 
465 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  34.76 
 
 
259 aa  151  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  37.19 
 
 
448 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  31.34 
 
 
446 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  37.14 
 
 
430 aa  150  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  35.43 
 
 
443 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  34.44 
 
 
421 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  32.21 
 
 
291 aa  149  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  32.87 
 
 
293 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  38.2 
 
 
420 aa  149  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  33.45 
 
 
279 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  33.45 
 
 
279 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  33.45 
 
 
279 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  33.94 
 
 
445 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0151  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.68 
 
 
433 aa  149  7e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  32.23 
 
 
299 aa  149  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  33.1 
 
 
279 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3952  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
423 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.173559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  33.45 
 
 
279 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  34.33 
 
 
429 aa  148  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  35.49 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  33.45 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0481  putative hemolysin  32.65 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00948682  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  38.03 
 
 
371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  34.65 
 
 
434 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  37.87 
 
 
281 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.47 
 
 
442 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  35.74 
 
 
438 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  32.27 
 
 
429 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  33.21 
 
 
280 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0993  hemolysin  36.67 
 
 
291 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0803506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  35.98 
 
 
420 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2698  transporter-associated region  36.32 
 
 
278 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  33.45 
 
 
280 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  35.59 
 
 
452 aa  145  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  33.2 
 
 
447 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  36.23 
 
 
309 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  31.67 
 
 
279 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0726  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.33 
 
 
292 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0772  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.33 
 
 
292 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  33.33 
 
 
425 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>