More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3669 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3669  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 245 aa  494  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  80.66 
 
 		 243 aa  407  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  79.01 
 
 		 243 aa  394  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  79.32 
 
 		 254 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  74.38 
 
 		 243 aa  381  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  76.64 
 
 		 244 aa  375  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  73.36 
 
 		 246 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  72.24 
 
 		 246 aa  367  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  69.83 
 
 		 251 aa  361  6e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  69.8 
 
 		 247 aa  353  1e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  64.58 
 
 		 244 aa  328  3e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  63.18 
 
 		 249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  64.44 
 
 		 244 aa  321  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  62.34 
 
 		 244 aa  315  3e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0288  ATPase  62.76 
 
 		 244 aa  315  6e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.017076 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  62.34 
 
 		 244 aa  312  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  62.34 
 
 		 244 aa  311  5.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  61.6 
 
 		 239 aa  308  5e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  61.09 
 
 		 244 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  60.92 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2741  ABC transporter related protein  64.68 
 
 		 245 aa  299  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  61.34 
 
 		 242 aa  299  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  60.34 
 
 		 244 aa  298  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  57.92 
 
 		 243 aa  295  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  59.23 
 
 		 249 aa  294  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1638  ABC transporter-like  62.29 
 
 		 242 aa  294  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0878817  normal  0.874871 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.05 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  59.66 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  59.66 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0513  ATPase  60.34 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.911954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  59.66 
 
 		 253 aa  292  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  56.9 
 
 		 241 aa  290  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  58.7 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0926  putative ABC transporter, ATPase subunit  58.65 
 
 		 265 aa  288  4e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.617438  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  61.11 
 
 		 277 aa  288  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  58.65 
 
 		 310 aa  288  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  56.78 
 
 		 240 aa  288  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  56.07 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.78 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  58.82 
 
 		 311 aa  287  9e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.78 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  56.9 
 
 		 246 aa  287  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  55.7 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  56.41 
 
 		 240 aa  286  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1488  ABC transporter related  58.23 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  59.5 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.3 
 
 		 241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.3 
 
 		 241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.3 
 
 		 241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0679  ABC transporter related  57.5 
 
 		 248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.3 
 
 		 241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  56.3 
 
 		 241 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  55.04 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  56.78 
 
 		 321 aa  285  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  56.72 
 
 		 259 aa  285  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  57.14 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  59.41 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  56.6 
 
 		 268 aa  285  7e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  55.7 
 
 		 247 aa  284  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3751  ABC transporter related  57.85 
 
 		 242 aa  284  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619335 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4389  ABC transporter-like protein protein  60.85 
 
 		 242 aa  283  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  59 
 
 		 258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  56.3 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  59 
 
 		 261 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0369  ABC transporter related protein  58.8 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0644  ABC transporter, ATP-binding protein  58.4 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00234663  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  58.37 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3310  ABC transporter-related protein  57.92 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000131342  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  59 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  58.58 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  58.58 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  54.62 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  56.49 
 
 		 241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  58.58 
 
 		 258 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  58.51 
 
 		 249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  58.51 
 
 		 249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0858  ABC transporter-like  56.72 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  57.38 
 
 		 288 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2121  ABC transporter related  57.2 
 
 		 243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2168  ABC transporter related  57.2 
 
 		 243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.14 
 
 		 241 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  56.38 
 
 		 262 aa  281  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  58.82 
 
 		 263 aa  281  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 		 262 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  58.58 
 
 		 258 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  56.9 
 
 		 239 aa  281  7.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2507  ABC transporter related  58.47 
 
 		 243 aa  281  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  58.58 
 
 		 258 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  56.72 
 
 		 241 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  58.58 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>