More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3657 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 928 aa  684    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 928 aa  684    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  39.41 
 
 		 932 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  40.76 
 
 		 891 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  40.81 
 
 		 915 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  47.68 
 
 		 926 aa  867    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 936 aa  638    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  40.54 
 
 		 917 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  40.86 
 
 		 906 aa  658    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  39.81 
 
 		 946 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  40.31 
 
 		 932 aa  660    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  42.45 
 
 		 936 aa  692    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  39.64 
 
 		 968 aa  668    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  41.08 
 
 		 930 aa  672    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  39.31 
 
 		 979 aa  660    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 922 aa  661    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  40.85 
 
 		 934 aa  644    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 973 aa  635    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  40.6 
 
 		 915 aa  652    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  40.5 
 
 		 908 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 928 aa  684    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  41.31 
 
 		 928 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 896 aa  672    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  40.44 
 
 		 896 aa  678    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  41.61 
 
 		 943 aa  702    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  42.24 
 
 		 956 aa  682    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.6 
 
 		 892 aa  681    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  42.12 
 
 		 888 aa  684    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 928 aa  684    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  40.73 
 
 		 934 aa  647    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  41.27 
 
 		 936 aa  704    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 1022 aa  681    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  40.64 
 
 		 918 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  56.89 
 
 		 936 aa  1095    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  41.49 
 
 		 903 aa  681    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  43.34 
 
 		 950 aa  719    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  41.61 
 
 		 944 aa  694    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  44.23 
 
 		 891 aa  753    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  41.88 
 
 		 928 aa  680    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  42.02 
 
 		 945 aa  690    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 924 aa  650    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  41.14 
 
 		 924 aa  681    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 921 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  41.95 
 
 		 892 aa  681    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  41.88 
 
 		 928 aa  683    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  41.26 
 
 		 939 aa  701    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  40.39 
 
 		 915 aa  651    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  41.42 
 
 		 928 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 892 aa  678    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  51.89 
 
 		 949 aa  996    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  40.76 
 
 		 903 aa  674    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  38.86 
 
 		 934 aa  640    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  40.81 
 
 		 915 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  39.98 
 
 		 937 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  41.07 
 
 		 938 aa  669    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  41.37 
 
 		 930 aa  668    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  41.08 
 
 		 921 aa  667    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  39.69 
 
 		 939 aa  648    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  41.31 
 
 		 928 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  42.71 
 
 		 926 aa  691    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 935 aa  668    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  41.31 
 
 		 928 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  40.06 
 
 		 930 aa  638    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  47.21 
 
 		 945 aa  850    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  41.8 
 
 		 921 aa  671    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  40.98 
 
 		 916 aa  668    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  41.32 
 
 		 928 aa  655    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  41.6 
 
 		 922 aa  668    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  41.27 
 
 		 988 aa  683    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  39.4 
 
 		 933 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  40.72 
 
 		 935 aa  653    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  41.23 
 
 		 943 aa  677    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  40.31 
 
 		 932 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  39.75 
 
 		 945 aa  648    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  40.83 
 
 		 928 aa  671    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  38.55 
 
 		 978 aa  653    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  100 
 
 		 946 aa  1943    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  42.77 
 
 		 923 aa  687    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  40.31 
 
 		 932 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 951 aa  654    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  41.32 
 
 		 942 aa  668    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  40.98 
 
 		 922 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  41.29 
 
 		 922 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  40.48 
 
 		 912 aa  650    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  42.01 
 
 		 918 aa  672    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  40.7 
 
 		 931 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 921 aa  668    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  41.58 
 
 		 933 aa  667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 913 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  42.04 
 
 		 928 aa  685    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  39.86 
 
 		 978 aa  667    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  41.31 
 
 		 928 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 928 aa  684    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 979 aa  659    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 976 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  39.29 
 
 		 911 aa  652    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  41.7 
 
 		 922 aa  674    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  42.07 
 
 		 930 aa  699    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  42.29 
 
 		 893 aa  707    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  40.5 
 
 		 946 aa  692    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>