101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3640 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  100 
 
 		 242 aa  501  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  35.44 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  29.95 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  30.43 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  30.24 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  29.61 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  32.24 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  29.77 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  30.88 
 
 		 224 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  31.22 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  26.96 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 210 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  31.34 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  31.31 
 
 		 200 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  29.52 
 
 		 210 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  28.71 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  30.29 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  30.84 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  28.84 
 
 		 210 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  29.72 
 
 		 238 aa  92  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  29.72 
 
 		 242 aa  91.7  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  31.84 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  31.18 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  29.67 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  30.05 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  29.36 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  29.61 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  31.77 
 
 		 206 aa  88.6  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  25.77 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  32.47 
 
 		 222 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  28.99 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  31.18 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  26.19 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  25.59 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  27 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  23.41 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  26.73 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  26.47 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  31.35 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  27.87 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  28.14 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  28.86 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  28.35 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  30.27 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  30.27 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  30.27 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  27.72 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  25.25 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  24.27 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  27.55 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  29.57 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  28.86 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  25.65 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  23.27 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  27.92 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  25.85 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  29.44 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  26.6 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  26.53 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  26.53 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  29.5 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  27.87 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  21.43 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  23.44 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  26.29 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  23.89 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  26.67 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  23.88 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  29.67 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  21.43 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  22.6 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  24.2 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  25.67 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  24.04 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  24.2 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  27 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  27 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  27 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  26.07 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  27 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  27 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  27 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  22.83 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  21.29 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  23.64 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  20.2 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3117  hypothetical protein  22.54 
 
 		 208 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  23.61 
 
 		 300 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  21.47 
 
 		 297 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  24.02 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  25 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2944  hypothetical protein  20.35 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  18.52 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1944  DSBA oxidoreductase  28.75 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2184  hypothetical protein  23.53 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00487522  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  19.82 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  21.72 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  18.98 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>