229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3588 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  100 
 
 		 1002 aa  2032    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  25.28 
 
 		 928 aa  145  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  24.12 
 
 		 905 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  24.31 
 
 		 903 aa  125  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  24.16 
 
 		 905 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  23.99 
 
 		 905 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  23.71 
 
 		 900 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  24.58 
 
 		 946 aa  122  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  22.45 
 
 		 905 aa  118  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  22.45 
 
 		 905 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  23 
 
 		 907 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  22.64 
 
 		 908 aa  112  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  24.14 
 
 		 754 aa  111  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.68 
 
 		 1203 aa  110  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.01 
 
 		 932 aa  105  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  27.85 
 
 		 916 aa  104  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  27.89 
 
 		 922 aa  103  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  26.78 
 
 		 1132 aa  101  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  24.17 
 
 		 758 aa  99  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  24.82 
 
 		 633 aa  96.3  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.77 
 
 		 1196 aa  96.3  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  24.28 
 
 		 633 aa  96.3  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  26.95 
 
 		 925 aa  94.4  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  26.04 
 
 		 906 aa  93.6  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  25.25 
 
 		 1185 aa  92.8  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  23.77 
 
 		 633 aa  92.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  27.07 
 
 		 958 aa  91.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  23.62 
 
 		 1335 aa  90.1  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1062 aa  87.8  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  24.67 
 
 		 914 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  24.32 
 
 		 902 aa  85.5  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  25 
 
 		 609 aa  82  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1220 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  24.6 
 
 		 636 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  24.4 
 
 		 1061 aa  80.9  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  25 
 
 		 1171 aa  80.1  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf701  putative ATP-binding helicase  24.68 
 
 		 1050 aa  80.5  0.0000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.94 
 
 		 752 aa  80.1  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1049 aa  79.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  23.69 
 
 		 1056 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 		 2101 aa  79.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 		 2101 aa  79.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  23.18 
 
 		 1087 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 		 2098 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  25.17 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1092 aa  77  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  25.72 
 
 		 636 aa  77  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  21.86 
 
 		 1620 aa  77  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  25.98 
 
 		 611 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  23.89 
 
 		 1190 aa  76.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  23.13 
 
 		 934 aa  76.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  26.57 
 
 		 975 aa  75.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  23.12 
 
 		 650 aa  75.1  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  22.35 
 
 		 986 aa  73.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  22.34 
 
 		 1523 aa  73.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  24.01 
 
 		 904 aa  73.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  22.51 
 
 		 629 aa  73.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  25.18 
 
 		 632 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  23.13 
 
 		 1999 aa  72.8  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  24.21 
 
 		 650 aa  72  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  23.81 
 
 		 635 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  23 
 
 		 1100 aa  72  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  27.05 
 
 		 1178 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  21.75 
 
 		 2207 aa  71.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  23.39 
 
 		 2104 aa  71.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1176 aa  71.2  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  26.76 
 
 		 1285 aa  71.2  0.00000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  23.08 
 
 		 914 aa  70.5  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  26.6 
 
 		 1178 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  24.83 
 
 		 1094 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  21.56 
 
 		 1724 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  25.23 
 
 		 2098 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  25.23 
 
 		 2098 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  23.57 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  25.46 
 
 		 1099 aa  68.6  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  24.83 
 
 		 2013 aa  68.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  23.55 
 
 		 643 aa  68.2  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  25.26 
 
 		 1557 aa  68.2  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  22.93 
 
 		 1991 aa  67.4  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  21.25 
 
 		 606 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.34 
 
 		 1363 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  22.64 
 
 		 902 aa  66.6  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  23.16 
 
 		 1803 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  23.63 
 
 		 633 aa  66.2  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  23.72 
 
 		 1153 aa  65.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  25.66 
 
 		 1630 aa  65.9  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  21.83 
 
 		 1280 aa  65.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  21.69 
 
 		 901 aa  65.5  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  20.65 
 
 		 1126 aa  65.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  20.04 
 
 		 1973 aa  65.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  22.57 
 
 		 1041 aa  65.1  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  26.95 
 
 		 1296 aa  64.7  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1018 aa  64.7  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  22.54 
 
 		 2759 aa  64.3  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  21.86 
 
 		 619 aa  64.3  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  22.04 
 
 		 941 aa  64.3  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  21.22 
 
 		 622 aa  63.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  24.54 
 
 		 1097 aa  63.5  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  23.74 
 
 		 479 aa  63.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  21.96 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>