207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3537 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3537  thiol peroxidase  100 
 
 
169 aa  343  8.999999999999999e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.515371 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  54.22 
 
 
170 aa  177  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  52.07 
 
 
168 aa  174  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  49.09 
 
 
172 aa  167  6e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  52.35 
 
 
168 aa  163  8e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.95 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  53.01 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50 
 
 
166 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  48.81 
 
 
199 aa  160  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  47.59 
 
 
166 aa  159  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  47.59 
 
 
166 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.99 
 
 
166 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  50.6 
 
 
166 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  47.88 
 
 
175 aa  158  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  48.19 
 
 
179 aa  158  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.59 
 
 
166 aa  158  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  49.4 
 
 
187 aa  158  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  48.19 
 
 
167 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  49.09 
 
 
166 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  47.56 
 
 
187 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  47.31 
 
 
167 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  47.31 
 
 
167 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  46.71 
 
 
167 aa  155  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  49.09 
 
 
166 aa  155  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  49.7 
 
 
166 aa  155  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  48.19 
 
 
166 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  47.31 
 
 
167 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  47.31 
 
 
167 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  47.31 
 
 
167 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  47.31 
 
 
167 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  50.6 
 
 
165 aa  154  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3469  thiol peroxidase  47.31 
 
 
167 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  48.19 
 
 
166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  48.19 
 
 
166 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  46.95 
 
 
167 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  46.95 
 
 
167 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  46.39 
 
 
166 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0323  thiol peroxidase (scavengase P20)  46.39 
 
 
174 aa  152  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000438204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3734  redoxin  47.27 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085288  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.99 
 
 
166 aa  150  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.63 
 
 
163 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.18 
 
 
166 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1717  Redoxin domain protein  43.71 
 
 
175 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0503  redoxin domain-containing protein  44.31 
 
 
167 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  47.62 
 
 
167 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0527  redoxin domain-containing protein  44.31 
 
 
167 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  47.62 
 
 
167 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  45.51 
 
 
181 aa  148  4e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  44.31 
 
 
167 aa  148  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  47.62 
 
 
165 aa  148  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  46.06 
 
 
165 aa  147  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  46.39 
 
 
166 aa  147  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0783  thiol peroxidase  48.21 
 
 
174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0570  redoxin domain-containing protein  44.31 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.913258  hitchhiker  0.00016403 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0601  redoxin domain-containing protein  44.31 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1193  redoxin domain-containing protein  44.24 
 
 
165 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  44.51 
 
 
168 aa  145  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2481  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.17 
 
 
166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.91 
 
 
166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  43.37 
 
 
166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  44.51 
 
 
168 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  44.51 
 
 
168 aa  144  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  44.51 
 
 
168 aa  144  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  47.02 
 
 
167 aa  144  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  44.51 
 
 
168 aa  144  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  44.51 
 
 
168 aa  144  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  44.51 
 
 
168 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  44.51 
 
 
168 aa  144  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  44.85 
 
 
165 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0118  redoxin  43.71 
 
 
167 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  44.24 
 
 
165 aa  144  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06240  thiol peroxidase  43.98 
 
 
166 aa  144  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  43.37 
 
 
166 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  43.9 
 
 
168 aa  143  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  42.77 
 
 
166 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1262  redoxin domain-containing protein  47.27 
 
 
165 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.828642 
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  45.83 
 
 
179 aa  141  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2803  redoxin domain-containing protein  42.77 
 
 
166 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.919062  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  42.77 
 
 
166 aa  142  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.67 
 
 
168 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3254  thiol peroxidase  50.59 
 
 
165 aa  142  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  44.24 
 
 
165 aa  141  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1807  thiol peroxidase  42.68 
 
 
168 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1650  thiol peroxidase  42.68 
 
 
168 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00495137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1468  thiol peroxidase  42.68 
 
 
168 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1868  thiol peroxidase  42.68 
 
 
168 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.188696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1806  thiol peroxidase  42.68 
 
 
168 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3684  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.11 
 
 
167 aa  140  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.484477  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  43.9 
 
 
168 aa  140  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0425  Redoxin domain protein  44.3 
 
 
166 aa  140  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  43.29 
 
 
167 aa  140  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0132  thiol peroxidase  43.11 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  42.42 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0870  thiol peroxidase  47.13 
 
 
175 aa  137  7e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0445504  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0800  thiol peroxidase  47.13 
 
 
175 aa  137  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.341037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  42.68 
 
 
167 aa  137  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.2 
 
 
166 aa  136  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1232  thiol peroxidase  46.5 
 
 
175 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  47.17 
 
 
167 aa  134  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  47.17 
 
 
167 aa  134  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>