More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3490 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  100 
 
 
344 aa  717    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4417  ferrochelatase  62.02 
 
 
357 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0649  ferrochelatase  58.06 
 
 
353 aa  431  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.26196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5683  ferrochelatase  48.5 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0596744  normal  0.050852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3617  ferrochelatase  47.75 
 
 
344 aa  332  8e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28599  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0468  ferrochelatase  48.3 
 
 
331 aa  312  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0492  ferrochelatase  47.99 
 
 
331 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2060  ferrochelatase  44.51 
 
 
354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000118171  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0153  ferrochelatase  44.51 
 
 
341 aa  301  7.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000811628  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03660  Ferrochelatase  41.54 
 
 
354 aa  275  6e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.379579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4730  ferrochelatase  40.9 
 
 
341 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0191393  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1333  ferrochelatase  40.82 
 
 
343 aa  268  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0785  ferrochelatase  40.9 
 
 
337 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0939  ferrochelatase  41.62 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0744  ferrochelatase  39.29 
 
 
338 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6498  ferrochelatase  43.24 
 
 
342 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.534245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1128  ferrochelatase  40.72 
 
 
340 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0967  ferrochelatase  40.42 
 
 
340 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0772  ferrochelatase  39.35 
 
 
338 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491475  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1077  ferrochelatase  40.66 
 
 
340 aa  258  7e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.78757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4445  ferrochelatase  39.4 
 
 
337 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447659  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41370  ferrochelatase  40.36 
 
 
338 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.507238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5304  ferrochelatase  38.71 
 
 
340 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61580  ferrochelatase  38.71 
 
 
340 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0802498 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  39.48 
 
 
364 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  37.35 
 
 
360 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2470  ferrochelatase  41.45 
 
 
345 aa  245  9e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.422721  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01329  ferrochelatase  37.68 
 
 
321 aa  242  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  36.1 
 
 
371 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  38.15 
 
 
343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  35.33 
 
 
371 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  37.54 
 
 
371 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  35.33 
 
 
371 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  38.17 
 
 
355 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  38.33 
 
 
364 aa  236  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0551  ferrochelatase  37.95 
 
 
320 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139306  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0536  ferrochelatase  37.95 
 
 
320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0595  ferrochelatase  37.95 
 
 
320 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0535  ferrochelatase  37.95 
 
 
320 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  36.87 
 
 
337 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0541  ferrochelatase  37.95 
 
 
320 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229981  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  38.3 
 
 
320 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  36.87 
 
 
337 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  35.71 
 
 
371 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  36.29 
 
 
371 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  36.78 
 
 
345 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  36.58 
 
 
370 aa  231  9e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  36.58 
 
 
327 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  36.58 
 
 
327 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  36.23 
 
 
337 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  36.39 
 
 
327 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  36.58 
 
 
344 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  36.23 
 
 
337 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  37.87 
 
 
337 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00426  ferrochelatase  37.57 
 
 
320 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0515  ferrochelatase  37.28 
 
 
320 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3141  ferrochelatase  37.57 
 
 
320 aa  227  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692979  hitchhiker  0.00475646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  36.66 
 
 
369 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00431  hypothetical protein  37.57 
 
 
320 aa  227  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0552  ferrochelatase  37.57 
 
 
320 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.425129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  36.5 
 
 
364 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  36.58 
 
 
327 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3135  Ferrochelatase  37.28 
 
 
320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.942163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  35.65 
 
 
373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0568  ferrochelatase  37.28 
 
 
320 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.414363  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0408  ferrochelatase  37.28 
 
 
320 aa  226  7e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.86584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  36.89 
 
 
354 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  35.78 
 
 
337 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  35.29 
 
 
359 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  35.78 
 
 
337 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0955  ferrochelatase  35.8 
 
 
320 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  35.78 
 
 
337 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0520  ferrochelatase  37.28 
 
 
320 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0674477  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  35.78 
 
 
337 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  34.78 
 
 
367 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  35.28 
 
 
352 aa  222  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  37.06 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  34.42 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  35.28 
 
 
352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  37.5 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  35.48 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3230  ferrochelatase  36.58 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  34.88 
 
 
356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  34.88 
 
 
356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  34.41 
 
 
367 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1081  ferrochelatase  36.28 
 
 
425 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  35.09 
 
 
367 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  34.82 
 
 
369 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2215  ferrochelatase  34.47 
 
 
330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.228153 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  35.48 
 
 
370 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  35.59 
 
 
367 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  35.12 
 
 
398 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  35.59 
 
 
367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  35.59 
 
 
367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  35.59 
 
 
367 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  35.59 
 
 
367 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  35.59 
 
 
367 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  35.59 
 
 
367 aa  215  9e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0127  ferrochelatase  35.78 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  35.71 
 
 
368 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>