More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3457 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3457  b-glycosyltransferase  100 
 
 
302 aa  619  1e-176  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0284988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
333 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
270 aa  89.4  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  27.93 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
455 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
310 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  40.86 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  40.86 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.86 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.86 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  40.86 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.86 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  26.98 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  29.81 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  37.82 
 
 
689 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.78 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  27.52 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
672 aa  75.5  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0426  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.75 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  39.25 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.57 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  38.83 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.14 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  27.27 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
321 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
544 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
430 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.95 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  39.08 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  39.81 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
415 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.95 
 
 
326 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.69 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.92 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  30.53 
 
 
242 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  33.33 
 
 
1148 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1186  glycosyl transferase family protein  38.04 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  36.21 
 
 
1157 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
773 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  40.21 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  41.86 
 
 
704 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  30.77 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  37.61 
 
 
785 aa  66.6  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  36.54 
 
 
1168 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
1301 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>