More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3402 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  100 
 
 
235 aa  488  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  52.14 
 
 
257 aa  256  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  49.15 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  42.74 
 
 
253 aa  207  9e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  39.67 
 
 
264 aa  184  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  39.06 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  40.17 
 
 
256 aa  182  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
226 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 
271 aa  169  5e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  38.98 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  36.6 
 
 
267 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  37.97 
 
 
265 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  34.75 
 
 
258 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  38.4 
 
 
255 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  38.4 
 
 
255 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  37.82 
 
 
254 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 
254 aa  158  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  37.97 
 
 
255 aa  158  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  37.39 
 
 
254 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
254 aa  158  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  37.82 
 
 
254 aa  158  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  37.82 
 
 
254 aa  158  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  37.82 
 
 
254 aa  158  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  37.82 
 
 
254 aa  158  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  36.97 
 
 
254 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 
260 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  32.62 
 
 
265 aa  155  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  37.29 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  36.55 
 
 
254 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  34.03 
 
 
261 aa  154  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  39.83 
 
 
257 aa  154  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413614  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  36.97 
 
 
256 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  36.02 
 
 
255 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
264 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  35.74 
 
 
259 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  35.71 
 
 
259 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  37.87 
 
 
311 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  36.55 
 
 
256 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  36.55 
 
 
256 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  36.55 
 
 
256 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  33.48 
 
 
268 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  36.13 
 
 
256 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
255 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  148  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  34.47 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  37.87 
 
 
260 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  33.64 
 
 
230 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  37.13 
 
 
262 aa  145  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
252 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  34.32 
 
 
255 aa  143  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 
257 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  34.03 
 
 
259 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 
253 aa  141  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  31.7 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  31.62 
 
 
256 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
256 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  36.11 
 
 
356 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
258 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  0.0000846948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  34.89 
 
 
255 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  36.44 
 
 
256 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  34.73 
 
 
258 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  34.73 
 
 
256 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
255 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  33.19 
 
 
280 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.79 
 
 
277 aa  125  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  33.48 
 
 
253 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  31.38 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 
258 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
258 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  30.17 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.93 
 
 
264 aa  116  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
258 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  30.08 
 
 
261 aa  115  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57391  predicted protein  31.76 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209701  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
263 aa  106  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  29.69 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 
326 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  24.29 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  24.17 
 
 
298 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
285 aa  68.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.69 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>