More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3360 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  68.45 
 
 
468 aa  656  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.97 
 
 
468 aa  673  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.26 
 
 
466 aa  698  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.24 
 
 
467 aa  675  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  100 
 
 
466 aa  946  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.53 
 
 
467 aa  638  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.8 
 
 
463 aa  525  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.08 
 
 
581 aa  514  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.17 
 
 
467 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.96 
 
 
467 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.53 
 
 
467 aa  506  1e-142  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.08 
 
 
469 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.67 
 
 
467 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.77 
 
 
468 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.34 
 
 
468 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.2 
 
 
468 aa  495  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.41 
 
 
467 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.43 
 
 
467 aa  494  1e-138  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.22 
 
 
480 aa  494  1e-138  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.43 
 
 
467 aa  493  1e-138  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.7 
 
 
467 aa  488  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.63 
 
 
468 aa  489  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.08 
 
 
467 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.13 
 
 
468 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.08 
 
 
467 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.49 
 
 
467 aa  487  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.96 
 
 
467 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.43 
 
 
467 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.47 
 
 
468 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.03 
 
 
471 aa  480  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.43 
 
 
466 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.72 
 
 
467 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.43 
 
 
462 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  53.03 
 
 
500 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  54.82 
 
 
464 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.09 
 
 
462 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.09 
 
 
462 aa  470  1e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.9 
 
 
470 aa  471  1e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.32 
 
 
476 aa  470  1e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.59 
 
 
476 aa  465  1e-130  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.03 
 
 
466 aa  467  1e-130  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.59 
 
 
476 aa  465  1e-130  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.8 
 
 
476 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.21 
 
 
462 aa  462  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.48 
 
 
476 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.05 
 
 
475 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.27 
 
 
476 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.37 
 
 
476 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.37 
 
 
476 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.37 
 
 
476 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.96 
 
 
478 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.69 
 
 
462 aa  465  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.37 
 
 
476 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.37 
 
 
476 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.17 
 
 
466 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.59 
 
 
477 aa  459  1e-128  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.37 
 
 
476 aa  460  1e-128  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.8 
 
 
478 aa  459  1e-128  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.42 
 
 
480 aa  461  1e-128  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  50.96 
 
 
478 aa  460  1e-128  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.8 
 
 
478 aa  459  1e-128  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.46 
 
 
474 aa  458  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.8 
 
 
470 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.95 
 
 
476 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.8 
 
 
478 aa  458  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.74 
 
 
476 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.75 
 
 
466 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.49 
 
 
466 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.95 
 
 
476 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.95 
 
 
476 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2319  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
475 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.74 
 
 
476 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.1 
 
 
475 aa  454  1e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.14 
 
 
465 aa  454  1e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
478 aa  454  1e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
478 aa  453  1e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.76 
 
 
459 aa  452  1e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 
478 aa  451  1e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.8 
 
 
474 aa  452  1e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.15 
 
 
462 aa  452  1e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.1 
 
 
466 aa  451  1e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.74 
 
 
476 aa  454  1e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.33 
 
 
466 aa  453  1e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1904  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.1 
 
 
475 aa  452  1e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.96 
 
 
478 aa  453  1e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 
478 aa  452  1e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.29 
 
 
463 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.15 
 
 
481 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.89 
 
 
466 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.89 
 
 
466 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
484 aa  445  1e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108932  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.03 
 
 
463 aa  446  1e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.06 
 
 
468 aa  445  1e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.05 
 
 
474 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3246  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.27 
 
 
475 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0895727  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.4 
 
 
460 aa  441  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  51.19 
 
 
511 aa  443  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.57 
 
 
473 aa  441  1e-122  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2881  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.54 
 
 
475 aa  441  1e-122  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2798  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.97 
 
 
479 aa  438  1e-122  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.535486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>