More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3350 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3350  integrase  100 
 
 		 308 aa  639    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00359362  decreased coverage  0.00980373 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  32.72 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.43 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  30.28 
 
 		 400 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.76 
 
 		 414 aa  132  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  28.15 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.53 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.53 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.08 
 
 		 390 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.88 
 
 		 376 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 376 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  27.42 
 
 		 370 aa  116  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.18 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.36 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.36 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  29.39 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.51 
 
 		 369 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.46 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.51 
 
 		 369 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.85 
 
 		 381 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  25.53 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  26.58 
 
 		 379 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  26.58 
 
 		 379 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  24.67 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  25.25 
 
 		 477 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  25.09 
 
 		 416 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  25.33 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  26.19 
 
 		 454 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  23.15 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  25.42 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  27.24 
 
 		 443 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.66 
 
 		 370 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  23.27 
 
 		 371 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  29.3 
 
 		 383 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.15 
 
 		 388 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  25.65 
 
 		 383 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  26.47 
 
 		 275 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.83 
 
 		 392 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.41 
 
 		 413 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  23.51 
 
 		 387 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  29.12 
 
 		 422 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  29.15 
 
 		 368 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.89 
 
 		 389 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  29.12 
 
 		 402 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.85 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  25.28 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  32.78 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  32.94 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  23.26 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.6 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.2 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  29.67 
 
 		 422 aa  82.4  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  22.64 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  21.65 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  25.83 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  24.19 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  24.74 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.4 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  24.09 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  27.48 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  28.2 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  22.64 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.72 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  23.81 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  25.28 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.52 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  25.82 
 
 		 381 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  30.59 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  25.49 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  25.43 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  22.39 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  25.19 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  23.37 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  24.12 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  27.14 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  22.97 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.17 
 
 		 451 aa  72.4  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  30.23 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  28.4 
 
 		 423 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  21.1 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  21.91 
 
 		 404 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  30.85 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  22.79 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  24.69 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  24.29 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  23.69 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  23.03 
 
 		 506 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  24.34 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  23.95 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  23.96 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  19.84 
 
 		 428 aa  68.9  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0989  integrase family protein  30 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000138199  hitchhiker  0.00000000000000368709 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  22.97 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  25.43 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  24.45 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>