More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3223 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  100 
 
 
286 aa  590  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  56.18 
 
 
283 aa  318  9e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  53.33 
 
 
273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2317  dihydropteroate synthase  52.36 
 
 
286 aa  295  8e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.052999  normal  0.0227117 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2108  dihydropteroate synthase  51.3 
 
 
272 aa  287  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3663  dihydropteroate synthase  51.99 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0223  dihydropteroate synthase  50.37 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000034848  normal  0.0279297 
 
 
-
 
NC_002950  PG1589  dihydropteroate synthase  51.49 
 
 
281 aa  282  4.0000000000000003e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.864925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5465  dihydropteroate synthase  45.13 
 
 
286 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  46.42 
 
 
278 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 
276 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  47.49 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  44.78 
 
 
282 aa  243  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  49.21 
 
 
287 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
282 aa  241  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
282 aa  241  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
282 aa  241  7e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
282 aa  241  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
282 aa  241  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
282 aa  241  7e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
282 aa  241  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  44.4 
 
 
282 aa  241  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  44.24 
 
 
277 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  44.24 
 
 
277 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 
277 aa  240  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
282 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 
277 aa  237  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  44.44 
 
 
282 aa  237  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
280 aa  237  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
277 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 
277 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  47.06 
 
 
278 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  46.62 
 
 
376 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  43.66 
 
 
277 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  46.27 
 
 
278 aa  235  6e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  43.8 
 
 
400 aa  235  7e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  43.28 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  43.28 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  43.28 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  45.91 
 
 
277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  43.28 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  44.88 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  51.59 
 
 
280 aa  231  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  43.4 
 
 
277 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  43.02 
 
 
277 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  50.79 
 
 
279 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  50.79 
 
 
279 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
282 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  45.08 
 
 
279 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  43.4 
 
 
277 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  43.02 
 
 
277 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  43.4 
 
 
277 aa  228  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  43.4 
 
 
277 aa  228  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  43.56 
 
 
280 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 
284 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 
283 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 
277 aa  225  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 
277 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  40.96 
 
 
311 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  48.81 
 
 
285 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  43.77 
 
 
277 aa  223  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  43.64 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  43.64 
 
 
283 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  43.31 
 
 
275 aa  222  6e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  46.96 
 
 
277 aa  222  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  41.76 
 
 
278 aa  221  8e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  45.63 
 
 
400 aa  221  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  41.54 
 
 
282 aa  220  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  46.88 
 
 
258 aa  219  5e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 
283 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
283 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 
280 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  42.48 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  44.96 
 
 
283 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 
280 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  46.56 
 
 
280 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  46.56 
 
 
280 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  41.79 
 
 
283 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 
280 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 
277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  41.85 
 
 
286 aa  215  7e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
266 aa  215  8e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  43.75 
 
 
286 aa  214  9e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  45.75 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  49.01 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  40.98 
 
 
274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1737  dihydropteroate synthase  40.85 
 
 
298 aa  212  7e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.183796  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 
275 aa  211  9e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  41.07 
 
 
283 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  43.35 
 
 
272 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  39.64 
 
 
277 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  41.26 
 
 
286 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  43.9 
 
 
281 aa  207  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
279 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 
399 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>