More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3146 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 
116 aa  229  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  60.17 
 
 
118 aa  146  1e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  63.25 
 
 
117 aa  144  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  61.54 
 
 
117 aa  144  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  2.57389e-05  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 
118 aa  144  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  60.5 
 
 
119 aa  138  2e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 
120 aa  137  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  60.34 
 
 
116 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  59.66 
 
 
119 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  59.66 
 
 
119 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  57.14 
 
 
119 aa  133  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  59.32 
 
 
118 aa  133  8e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  55.93 
 
 
118 aa  133  9e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  58.47 
 
 
117 aa  132  1e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 
118 aa  130  9e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.95755e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  58.04 
 
 
114 aa  127  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  57.63 
 
 
117 aa  126  8e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 
120 aa  125  1e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.09054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 
120 aa  125  1e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.02498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 
120 aa  125  1e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 
120 aa  126  1e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.11819e-09  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 
120 aa  125  1e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.40079e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 
120 aa  125  1e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.18216e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 
120 aa  125  1e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.39258e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 
120 aa  125  1e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09989e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  53.7 
 
 
116 aa  125  2e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 
117 aa  124  4e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  56.14 
 
 
120 aa  124  4e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  52.5 
 
 
120 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  55 
 
 
120 aa  124  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.42863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  52.14 
 
 
120 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.38516e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  54.55 
 
 
124 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 
112 aa  121  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 
119 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2280  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 
119 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  1.51304e-08  hitchhiker  0.00323172 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  56.14 
 
 
119 aa  120  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  51.72 
 
 
116 aa  120  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 
120 aa  120  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 
120 aa  119  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  53.28 
 
 
122 aa  119  1e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 
119 aa  118  2e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  55 
 
 
120 aa  119  2e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  57.27 
 
 
120 aa  119  2e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  57.27 
 
 
120 aa  119  2e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 
115 aa  118  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 
120 aa  117  4e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  5.04342e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  49.15 
 
 
124 aa  117  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 
119 aa  116  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  56.07 
 
 
120 aa  116  1e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  53.33 
 
 
119 aa  115  1e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  52.25 
 
 
119 aa  115  1e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  2.34169e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  56.19 
 
 
125 aa  116  1e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 
119 aa  115  2e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 
120 aa  115  2e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 
119 aa  115  2e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  58.16 
 
 
117 aa  115  2e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 
120 aa  114  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  53.27 
 
 
120 aa  114  4e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 
119 aa  114  4e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1356  ribosomal protein L18  60 
 
 
117 aa  114  4e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  53.04 
 
 
122 aa  114  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  50.85 
 
 
122 aa  114  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.6259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 
115 aa  114  5e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 
121 aa  114  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  51.85 
 
 
122 aa  113  9e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  52.73 
 
 
137 aa  112  2e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  52.78 
 
 
122 aa  112  2e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  49.21 
 
 
122 aa  112  2e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.55959e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  54.95 
 
 
112 aa  112  2e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  56.86 
 
 
121 aa  112  2e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  51.72 
 
 
126 aa  112  2e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  56.86 
 
 
120 aa  112  2e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  51.33 
 
 
120 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  53.04 
 
 
122 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  56.19 
 
 
118 aa  111  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  49.54 
 
 
118 aa  111  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.579e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  51.64 
 
 
122 aa  110  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 
136 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  6.97313e-06  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  50.45 
 
 
119 aa  110  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  58.42 
 
 
120 aa  110  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
121 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.62342e-09  hitchhiker  3.24401e-08 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  57.61 
 
 
118 aa  110  7e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  49.14 
 
 
118 aa  110  8e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  56.19 
 
 
122 aa  110  8e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2758  ribosomal protein L18  55.67 
 
 
117 aa  110  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00984012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 
120 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 
120 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  54.37 
 
 
128 aa  109  1e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  51.24 
 
 
120 aa  109  1e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  52.99 
 
 
121 aa  109  1e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  54.46 
 
 
122 aa  109  1e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 
120 aa  108  2e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  49.17 
 
 
123 aa  109  2e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 
124 aa  109  2e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.00708e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  51.24 
 
 
122 aa  108  2e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0564  50S ribosomal protein L18  59.38 
 
 
120 aa  109  2e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  49.58 
 
 
120 aa  109  2e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  53.98 
 
 
120 aa  108  2e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 
122 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  51.33 
 
 
120 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>