More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3107 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  100 
 
 		 272 aa  558  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.44 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  47.76 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.38 
 
 		 273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 		 266 aa  239  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  35.66 
 
 		 283 aa  171  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  36.16 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 		 287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.19 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  34.91 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3545  short chain dehydrogenase  41.21 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.351676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 		 268 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.33 
 
 		 298 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  37.33 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  36.87 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.34 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1300  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6530  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.744865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6137  short chain dehydrogenase  41.48 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  0.683407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  32.41 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  35.07 
 
 		 847 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  40.88 
 
 		 268 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 		 272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 274 aa  151  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  31.46 
 
 		 272 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 		 280 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3447  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 273 aa  148  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  31.41 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 		 285 aa  148  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.23 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 		 291 aa  145  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  33.69 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  36.65 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 284 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.92 
 
 		 276 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  34.26 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  32.96 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 281 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  30.32 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  35.55 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 276 aa  142  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0971  Short-chain alcohol dehydrogenase  36.36 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1152  putative Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.33 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  38.8 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3322  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0896668  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  30.51 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>