218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3049 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  100 
 
 
177 aa  366  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  52.91 
 
 
182 aa  197  7.999999999999999e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.46 
 
 
183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  46.59 
 
 
184 aa  168  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 
181 aa  144  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  41.9 
 
 
188 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  39.77 
 
 
188 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  37.43 
 
 
182 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.2 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.84 
 
 
182 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.84 
 
 
182 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.66 
 
 
183 aa  124  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.3 
 
 
199 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.64 
 
 
188 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  33.53 
 
 
200 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  38.51 
 
 
167 aa  120  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.93 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.8 
 
 
192 aa  117  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  37.99 
 
 
181 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.08 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  34.07 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  37.27 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  36.88 
 
 
178 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.97 
 
 
188 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  33.97 
 
 
188 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  36.87 
 
 
181 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  39.66 
 
 
181 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  33.97 
 
 
188 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.46 
 
 
189 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.14 
 
 
183 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  31.85 
 
 
199 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.81 
 
 
185 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  38.55 
 
 
178 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  36.55 
 
 
185 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  32.57 
 
 
186 aa  101  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  32.57 
 
 
194 aa  100  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.36 
 
 
187 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.71 
 
 
180 aa  99.4  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  32.57 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.62 
 
 
201 aa  98.6  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.55 
 
 
190 aa  98.2  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
180 aa  97.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.25 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.82 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
187 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.87 
 
 
193 aa  96.3  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 
187 aa  94.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  31.67 
 
 
183 aa  94  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.81 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.55 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.14 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.9 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
182 aa  89  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  34.57 
 
 
204 aa  88.2  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  33.15 
 
 
181 aa  87  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  35.71 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  36.99 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.74 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  35.06 
 
 
199 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.53 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  31.55 
 
 
215 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.1 
 
 
201 aa  85.1  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.3 
 
 
203 aa  84.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.82 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.12 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  31.98 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.18 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.94 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.68 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.48 
 
 
221 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  30.9 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  30.9 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.76 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.06 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  37.72 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.22 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.41 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.29 
 
 
196 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  28.09 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.23 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.23 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  27.27 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  29.38 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  39.81 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  30.68 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.19 
 
 
217 aa  73.9  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.64 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.29 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  29.75 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  32.17 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.22 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.01 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  34.68 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.45 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.63 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.48 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.43 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>