More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3038 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
128 aa  256  7e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  62.5 
 
 
128 aa  170  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  61.72 
 
 
128 aa  166  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 
128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 
128 aa  159  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  60.94 
 
 
128 aa  157  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 
128 aa  154  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  60.98 
 
 
133 aa  153  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  57.03 
 
 
128 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  54.33 
 
 
129 aa  141  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 
131 aa  137  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
161 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0881  ribosomal protein S9  58.06 
 
 
129 aa  137  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 
130 aa  137  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 
129 aa  136  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 
130 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 
129 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 
136 aa  134  4e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
161 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
161 aa  134  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
162 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 
124 aa  134  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  54.33 
 
 
131 aa  134  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  53.28 
 
 
131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  51.97 
 
 
129 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  57.02 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  57.02 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  131  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0014  ribosomal protein S9  59.02 
 
 
130 aa  131  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  55.28 
 
 
130 aa  130  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
159 aa  130  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 
131 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
159 aa  130  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
160 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  58.68 
 
 
132 aa  130  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  47.15 
 
 
161 aa  130  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
160 aa  130  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  53.97 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0469  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0839  ribosomal protein S9  53.28 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0411  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000014619  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0912  30S ribosomal protein S9  48.06 
 
 
129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  51.22 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_002950  PG0376  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 
128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  48.06 
 
 
129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1735  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 
131 aa  127  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0401133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
158 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 
132 aa  126  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
158 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  47.97 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0367  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000448381  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1908  ribosomal protein S9  47.29 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0382  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0184231  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
158 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0491  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0372353  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0972  ribosomal protein S9  51.64 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77895e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  56.56 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1940  ribosomal protein S9  49.61 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0388  30S ribosomal protein S9  45.74 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  125  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  47.97 
 
 
164 aa  124  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
159 aa  124  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  53.72 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0738  30S ribosomal protein S9  47.29 
 
 
129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.211677  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  53.72 
 
 
133 aa  124  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  51.61 
 
 
131 aa  124  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>