More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3024 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  100 
 
 
187 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  60.11 
 
 
189 aa  240  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  62.22 
 
 
187 aa  230  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  58.76 
 
 
185 aa  221  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  53.65 
 
 
185 aa  191  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  53.7 
 
 
169 aa  184  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  57.23 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  51.88 
 
 
180 aa  179  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  45.86 
 
 
163 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  49.65 
 
 
168 aa  151  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 
166 aa  150  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 
166 aa  150  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  45.75 
 
 
168 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  44.79 
 
 
168 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  49.65 
 
 
167 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  49.65 
 
 
167 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  45.28 
 
 
161 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  47.52 
 
 
188 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  48.94 
 
 
164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  45.7 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  47.52 
 
 
160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  48.32 
 
 
171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  47.26 
 
 
161 aa  145  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  48.89 
 
 
178 aa  144  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  43.14 
 
 
166 aa  143  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  45.75 
 
 
169 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  48.94 
 
 
167 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  49.24 
 
 
161 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  43.14 
 
 
166 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  48.48 
 
 
160 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  48.85 
 
 
161 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  48.85 
 
 
161 aa  140  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  49.25 
 
 
188 aa  139  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 
180 aa  138  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  49.24 
 
 
161 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  49.24 
 
 
161 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  44.3 
 
 
167 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  48.51 
 
 
178 aa  136  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  51.67 
 
 
161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  45.83 
 
 
153 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  44.81 
 
 
162 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  48.48 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  48.12 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  47.41 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  47.83 
 
 
162 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  46.38 
 
 
161 aa  122  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  45.14 
 
 
179 aa  120  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  43.9 
 
 
180 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  41.13 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 
167 aa  109  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  36.73 
 
 
158 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  34.84 
 
 
169 aa  108  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  36.42 
 
 
155 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
248 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  38.06 
 
 
170 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.15 
 
 
159 aa  102  5e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1397  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 
172 aa  101  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  39.58 
 
 
168 aa  97.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 
159 aa  97.8  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  37.12 
 
 
175 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  36.67 
 
 
158 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  38.89 
 
 
168 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 
170 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  36.6 
 
 
159 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  36.6 
 
 
159 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  36.6 
 
 
159 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  36.6 
 
 
159 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  35.62 
 
 
158 aa  95.5  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.95 
 
 
159 aa  95.1  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  35.95 
 
 
159 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  35.95 
 
 
159 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  35.95 
 
 
159 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.42 
 
 
159 aa  94.7  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  37.75 
 
 
158 aa  94.7  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  38.16 
 
 
161 aa  94.4  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  36.92 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  36.69 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.1 
 
 
160 aa  92.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  38.06 
 
 
171 aa  91.3  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  38.06 
 
 
172 aa  91.3  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  34.64 
 
 
164 aa  90.9  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  36.13 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  34.25 
 
 
161 aa  90.5  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  36.13 
 
 
163 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  35.71 
 
 
161 aa  90.5  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  30.07 
 
 
171 aa  89.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 
170 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  43.64 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 
170 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  43.64 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 
161 aa  88.6  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  42.73 
 
 
168 aa  88.2  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  42.73 
 
 
168 aa  88.2  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  42.73 
 
 
168 aa  88.2  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>