More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2993 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  100 
 
 		 712 aa  1475    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  28.93 
 
 		 658 aa  229  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  32.94 
 
 		 638 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  33.27 
 
 		 631 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  30.75 
 
 		 631 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  29.9 
 
 		 630 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  29.51 
 
 		 641 aa  210  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  30.51 
 
 		 656 aa  194  4e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  27.51 
 
 		 640 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  26.9 
 
 		 620 aa  178  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  26.43 
 
 		 673 aa  161  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  27.56 
 
 		 668 aa  157  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  24.56 
 
 		 673 aa  157  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  28.36 
 
 		 903 aa  157  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  27.84 
 
 		 626 aa  155  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  27.06 
 
 		 650 aa  154  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  26.73 
 
 		 704 aa  154  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  26.61 
 
 		 648 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  27.52 
 
 		 671 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.18 
 
 		 656 aa  146  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  26.73 
 
 		 653 aa  145  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  24.1 
 
 		 670 aa  145  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  25.74 
 
 		 669 aa  145  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  26.58 
 
 		 645 aa  144  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  27.84 
 
 		 679 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  23.77 
 
 		 694 aa  141  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  23.86 
 
 		 672 aa  136  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  26.69 
 
 		 648 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  23.97 
 
 		 665 aa  133  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  26.48 
 
 		 666 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  23.93 
 
 		 517 aa  130  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  27 
 
 		 525 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  25.14 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  24.51 
 
 		 509 aa  125  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  24.42 
 
 		 630 aa  124  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  26.32 
 
 		 660 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  24.42 
 
 		 519 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  26.17 
 
 		 643 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  27.42 
 
 		 613 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  25.52 
 
 		 798 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  24.61 
 
 		 642 aa  112  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  24.41 
 
 		 510 aa  111  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  25.17 
 
 		 585 aa  111  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  26.27 
 
 		 677 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  47.52 
 
 		 412 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40.6 
 
 		 218 aa  93.6  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  28.74 
 
 		 586 aa  93.6  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  25.95 
 
 		 712 aa  91.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  24.52 
 
 		 757 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  37.19 
 
 		 417 aa  89.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 333 aa  88.6  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 510 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  45.36 
 
 		 424 aa  87.4  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  24.52 
 
 		 813 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  37.07 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  43.81 
 
 		 319 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 333 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  45.54 
 
 		 320 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 210 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  35.94 
 
 		 490 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  36.07 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  36.89 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  40.2 
 
 		 352 aa  83.2  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 		 445 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  41.28 
 
 		 422 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 360 aa  83.2  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  36.75 
 
 		 380 aa  83.2  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  37.14 
 
 		 344 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.19 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  39.13 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  36.19 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.14 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  29.31 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  36.19 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  35.24 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 543 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 		 209 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.38 
 
 		 542 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 440 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  27.23 
 
 		 239 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  26.61 
 
 		 432 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 223 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.79 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 		 209 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 544 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 434 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  36.19 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 306 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 202 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 376 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 202 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 		 202 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 		 202 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  42.61 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  36.45 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  31.67 
 
 		 169 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>