23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2991 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  709    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2973  hypothetical protein  38.73 
 
 
365 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1629  hypothetical protein  36.78 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2755  hypothetical protein  33.92 
 
 
339 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2037  hypothetical protein  30.09 
 
 
350 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672069  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10348  hypothetical protein  30.35 
 
 
344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0435  hypothetical protein  27.14 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000627827  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0602  hypothetical protein  24.78 
 
 
346 aa  92  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  26.43 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  33.53 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  26.41 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  28.82 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  24.71 
 
 
394 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  29.39 
 
 
351 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  26.99 
 
 
344 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  25.29 
 
 
391 aa  53.1  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  26.64 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  23.35 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  28.4 
 
 
385 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0357  hypothetical protein  28.32 
 
 
346 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12378  hypothetical protein  26.74 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260856  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  23.3 
 
 
390 aa  43.5  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  26.18 
 
 
361 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>