291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2977 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  48.47 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1690  dethiobiotin synthase  49.49 
 
 
202 aa  185  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.439314  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  54.24 
 
 
204 aa  185  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  45.96 
 
 
205 aa  170  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  43.56 
 
 
210 aa  161  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  43.63 
 
 
210 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  41.29 
 
 
210 aa  153  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  43.02 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  40 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  43.75 
 
 
212 aa  138  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  43.75 
 
 
212 aa  138  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  40.31 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  39.8 
 
 
213 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  41.24 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  38.66 
 
 
216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  41.5 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  38.66 
 
 
216 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  43.53 
 
 
209 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  41.4 
 
 
212 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  45.56 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  36.08 
 
 
219 aa  132  5e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  42.44 
 
 
206 aa  131  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1255  dithiobiotin synthetase  43.58 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.52735 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  38.51 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  39.41 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  39.66 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  39.11 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  39.08 
 
 
221 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  36.92 
 
 
474 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  34.2 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  40.74 
 
 
202 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  38.92 
 
 
221 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  36.22 
 
 
217 aa  122  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3319  dithiobiotin synthetase  42.29 
 
 
212 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  43.6 
 
 
213 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  36.14 
 
 
216 aa  115  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  33.68 
 
 
242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0083  dethiobiotin synthase  35.84 
 
 
203 aa  111  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1390  dethiobiotin synthetase  35.93 
 
 
190 aa  99.4  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  36.36 
 
 
228 aa  97.8  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  37.36 
 
 
212 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  38.42 
 
 
232 aa  95.9  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0040  dethiobiotin synthase  34.5 
 
 
215 aa  95.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  35.63 
 
 
212 aa  94.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2597  dethiobiotin synthase  30.09 
 
 
263 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.204799  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  34.12 
 
 
221 aa  92.8  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  36.42 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  38.41 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0353  dethiobiotin synthetase  35.85 
 
 
201 aa  92  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.789555  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0330  dethiobiotin synthetase  35.85 
 
 
201 aa  92  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  34.21 
 
 
249 aa  91.7  8e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  34.1 
 
 
238 aa  90.5  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  34.18 
 
 
242 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  34.88 
 
 
266 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  34.88 
 
 
646 aa  89.4  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  34.09 
 
 
225 aa  89  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  35.59 
 
 
240 aa  88.6  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0517  dethiobiotin synthase  32 
 
 
221 aa  88.2  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  34.09 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  34.09 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  33.52 
 
 
225 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  34.09 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  34.09 
 
 
225 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  31.89 
 
 
227 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  33.52 
 
 
225 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  35.39 
 
 
237 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  34.09 
 
 
225 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  35.03 
 
 
240 aa  86.7  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  35.03 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1658  dethiobiotin synthetase  34.59 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  32.95 
 
 
225 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  37.95 
 
 
212 aa  85.5  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  35.88 
 
 
226 aa  85.1  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  37.14 
 
 
230 aa  85.1  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  31.64 
 
 
234 aa  85.1  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4683  dithiobiotin synthetase  35.84 
 
 
226 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.462604  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  29.73 
 
 
242 aa  84.7  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  31.4 
 
 
217 aa  84.7  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  34.12 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  34.3 
 
 
249 aa  84  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  33.7 
 
 
238 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  34.25 
 
 
228 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  35.43 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  34.88 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  31.64 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  31.98 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  31.98 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  34.08 
 
 
225 aa  82  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  31.07 
 
 
226 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  35.09 
 
 
239 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  32.35 
 
 
241 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  32.76 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  31.34 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  32.37 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  32.5 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  29.57 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  29.57 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  36.43 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  33.52 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>