290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2960 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2960  DNA resolvase  100 
 
 		 217 aa  435  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000168825  unclonable  0.00000591562 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0050  DNA-invertase from lambdoid prophage Qin  33.66 
 
 		 207 aa  122  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112897  hitchhiker  0.000566383 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  31.5 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1099  resolvase domain-containing protein  29.3 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2896  resolvase-like protein  30.32 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.232346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0540  Resolvase domain protein  34.98 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  28.87 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  29.14 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  30.92 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  32.69 
 
 		 187 aa  72  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  29.06 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  28.66 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  29.06 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  29.06 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  29.06 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  30.84 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  29.68 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  29.06 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  29.06 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  31.53 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  29.41 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  28.57 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  28.57 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  28.57 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  32.1 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  32.48 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  31.87 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  32.28 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  28.93 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4253  resolvase-like protein  29.34 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4263  resolvase-like protein  29.34 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  31.65 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  28.64 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1138  resolvase-like protein  30.18 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00747364  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  29.59 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  27.16 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  29.65 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  28.29 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  30.1 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  28.43 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  28.87 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  30.38 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  30.38 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  29.67 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  32.72 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  30.3 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  27.32 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  29.02 
 
 		 193 aa  62  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  29.27 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  28.95 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  27.89 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  29.56 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04260  hypothetical protein  23.35 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  26.77 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.27 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  28.48 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25950  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  27.93 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0076  resolvase domain-containing protein  24.86 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0254  resolvase domain-containing protein  25.71 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0277  resolvase domain-containing protein  25.71 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0887  resolvase domain-containing protein  25.71 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  26.29 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  28.66 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  27.95 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  26.29 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0073  resolvase domain-containing protein  25.71 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  26.29 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  27.57 
 
 		 542 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  27.1 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  27.57 
 
 		 542 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  27.57 
 
 		 542 aa  59.3  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  29.81 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  25.31 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  27.36 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  27.98 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0445  resolvase/integrase-like protein  28.27 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.65944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  24.26 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  28.16 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  30.82 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  27.13 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28731  hypothetical protein  34.59 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  27.18 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  27.74 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  28.84 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  29.61 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  26.73 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  28.93 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  26.54 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  29.3 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  28.12 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3376  resolvase domain-containing protein  26.7 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127652  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  27.27 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  29.94 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  27.04 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  29.09 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  28.67 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  27.14 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.33 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  28.22 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  25.66 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>