More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2917 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  100 
 
 
181 aa  370  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  65.56 
 
 
180 aa  261  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  51.91 
 
 
185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.13 
 
 
176 aa  154  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.96 
 
 
178 aa  150  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.22 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.78 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.04 
 
 
192 aa  110  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  35.6 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.62 
 
 
188 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  30.43 
 
 
175 aa  104  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  34.78 
 
 
178 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  32.79 
 
 
185 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  33.88 
 
 
172 aa  97.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  28.02 
 
 
194 aa  97.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.15 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.26 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.11 
 
 
179 aa  95.5  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
188 aa  95.5  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.57 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.69 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
194 aa  94.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  32.42 
 
 
181 aa  94.4  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
188 aa  94  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  30.05 
 
 
178 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  31.18 
 
 
189 aa  92  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.72 
 
 
181 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
183 aa  91.3  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  30.53 
 
 
182 aa  89  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
181 aa  89  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  33.15 
 
 
177 aa  87  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
192 aa  84.7  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  31.11 
 
 
183 aa  84.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  31.35 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.02 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.87 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.72 
 
 
188 aa  81.3  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  30.34 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  29.24 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.17 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  30.6 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.6 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.07 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  28.65 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.6 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.72 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  28.42 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  28.42 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  27.49 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  27.49 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  28.19 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  28.27 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  27.49 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.16 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  27.47 
 
 
204 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.04 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  28.07 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.27 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  28.07 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  25.81 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.95 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  30.96 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.89 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.03 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  26.78 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.18 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.88 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  31.21 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  29.5 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  27.49 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.81 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  26.02 
 
 
221 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  26.04 
 
 
200 aa  74.3  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.37 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  29.08 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.13 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  29.12 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2707  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.29 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  28.73 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  29.02 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  29.51 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  29.38 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.47 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  27.06 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  27.42 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  29.38 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  30.17 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.42 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.74 
 
 
221 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.6 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.26 
 
 
221 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  30.16 
 
 
195 aa  72  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>