242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2855 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2967  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.04 
 
 		 910 aa  801    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000103268 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0683  Phosphoenolpyruvate carboxylase  49.56 
 
 		 922 aa  886    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.781097  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0058  Phosphoenolpyruvate carboxylase  47.42 
 
 		 910 aa  834    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1629  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.38 
 
 		 923 aa  811    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.94 
 
 		 911 aa  826    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0209  Phosphoenolpyruvate carboxylase  47.25 
 
 		 912 aa  816    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0606  Phosphoenolpyruvate carboxylase  50.44 
 
 		 922 aa  905    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2855  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 922 aa  1901    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0577  Phosphoenolpyruvate carboxylase  48.74 
 
 		 922 aa  868    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.222337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2974  phosphoenolpyruvate carboxylase  46.39 
 
 		 914 aa  793    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0559  phosphoenolpyruvate carboxylase  50.05 
 
 		 922 aa  888    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3110  phosphoenolpyruvate carboxylase  45.62 
 
 		 908 aa  792    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0808  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.91 
 
 		 908 aa  833    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1801  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.53 
 
 		 922 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.369049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1753  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.41 
 
 		 922 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0935488  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2137  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.41 
 
 		 922 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.24789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7118  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.21 
 
 		 920 aa  475  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6558  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.38 
 
 		 920 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.985726  normal  0.0731651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1718  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.71 
 
 		 919 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3664  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.94 
 
 		 916 aa  458  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387741  normal  0.313845 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3255  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.81 
 
 		 920 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5925  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.15 
 
 		 946 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613814  normal  0.197386 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32 
 
 		 906 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.73 
 
 		 939 aa  392  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.34 
 
 		 929 aa  392  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.34 
 
 		 929 aa  392  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.67 
 
 		 932 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.1 
 
 		 929 aa  386  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  30.39 
 
 		 938 aa  386  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.68 
 
 		 928 aa  386  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.97 
 
 		 946 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.35 
 
 		 957 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.99 
 
 		 933 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.98 
 
 		 936 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1819  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.32 
 
 		 923 aa  376  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.43 
 
 		 933 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.33 
 
 		 946 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.37 
 
 		 945 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.33 
 
 		 946 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.11 
 
 		 947 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.33 
 
 		 946 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.58 
 
 		 952 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.54 
 
 		 928 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.5 
 
 		 926 aa  369  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.42 
 
 		 954 aa  369  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.48 
 
 		 931 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.91 
 
 		 929 aa  365  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.39 
 
 		 936 aa  365  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.67 
 
 		 937 aa  365  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.41 
 
 		 949 aa  363  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.66 
 
 		 926 aa  360  5e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.3 
 
 		 1018 aa  360  9e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.69 
 
 		 918 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.01 
 
 		 896 aa  358  2.9999999999999997e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.3 
 
 		 929 aa  358  3.9999999999999996e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.22 
 
 		 926 aa  357  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.86 
 
 		 947 aa  356  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.79 
 
 		 920 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.56 
 
 		 1002 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.36 
 
 		 994 aa  352  2e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.56 
 
 		 929 aa  352  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2536  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.54 
 
 		 921 aa  352  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  30.5 
 
 		 933 aa  351  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.45 
 
 		 951 aa  351  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0841  Phosphoenolpyruvate carboxylase  31.9 
 
 		 939 aa  350  6e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.24 
 
 		 994 aa  350  8e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.38 
 
 		 900 aa  348  4e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3135  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.47 
 
 		 929 aa  347  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.365231  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.62 
 
 		 1075 aa  347  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.38 
 
 		 949 aa  346  8.999999999999999e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.6 
 
 		 949 aa  346  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  30.54 
 
 		 937 aa  346  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.01 
 
 		 934 aa  345  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.45 
 
 		 1017 aa  345  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.5 
 
 		 950 aa  345  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1714  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.46 
 
 		 957 aa  344  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.686661  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.1 
 
 		 928 aa  344  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.1 
 
 		 972 aa  343  8e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.34 
 
 		 994 aa  342  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0707  Phosphoenolpyruvate carboxylase  30.8 
 
 		 884 aa  342  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  30.53 
 
 		 898 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.36 
 
 		 982 aa  341  2.9999999999999998e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  30.73 
 
 		 940 aa  340  9e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  30.56 
 
 		 914 aa  339  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.81 
 
 		 938 aa  338  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.42 
 
 		 937 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3081  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.21 
 
 		 889 aa  338  2.9999999999999997e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.134099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.73 
 
 		 989 aa  338  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.71 
 
 		 1002 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.54 
 
 		 997 aa  337  5e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  30.89 
 
 		 896 aa  337  5.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.83 
 
 		 1023 aa  337  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.12 
 
 		 981 aa  336  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.85 
 
 		 1001 aa  336  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.8 
 
 		 930 aa  336  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.84 
 
 		 985 aa  335  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.74 
 
 		 1007 aa  335  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  29.79 
 
 		 970 aa  335  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.93 
 
 		 1030 aa  333  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.18 
 
 		 1021 aa  333  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>