More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2825 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  100 
 
 		 202 aa  420  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  57.58 
 
 		 203 aa  228  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  59.47 
 
 		 191 aa  225  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  56.91 
 
 		 208 aa  214  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0747  ribonuclease HII  51.74 
 
 		 198 aa  204  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05540  putative ribonuclease HII  51.89 
 
 		 199 aa  201  4e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.734266  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0851  Ribonuclease H  54.04 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  53.19 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  53.37 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  51.09 
 
 		 196 aa  180  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  44.6 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  52.17 
 
 		 206 aa  175  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  50.81 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  48.44 
 
 		 207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 210 aa  164  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  49.16 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  48.69 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  49.15 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  46.84 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  49.46 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  47.21 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 211 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  47.12 
 
 		 235 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  45.6 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  46.19 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  48.94 
 
 		 249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  41.24 
 
 		 207 aa  151  5e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  46.96 
 
 		 199 aa  151  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  47.75 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  46.89 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 256 aa  149  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  41.92 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  46.28 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  47.73 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  45.69 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1019  RNase HII  43.55 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0388624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  45.74 
 
 		 248 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  47.46 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  46.19 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  46.19 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  46.19 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  45.18 
 
 		 217 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 209 aa  147  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  47.72 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  47.72 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  47.72 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  47.72 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  47.72 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  47.72 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  47.72 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  47.72 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  48.31 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  46.89 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  44.5 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  48.31 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  45.2 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  46.56 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  46.89 
 
 		 207 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 240 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  45.08 
 
 		 211 aa  144  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  47.73 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  45.76 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0017  ribonuclease HII  46.63 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  44.86 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  43.88 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  50 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  44.28 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  48.59 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2627  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0862434 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  44.63 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  45.2 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  47.75 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  43.65 
 
 		 197 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1292  Ribonuclease H  40.82 
 
 		 209 aa  142  5e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000358144  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  46.33 
 
 		 277 aa  141  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 201 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 199 aa  140  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  47.46 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  44.94 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  42.55 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 283 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2801  ribonuclease HII  48.62 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.907957 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  46.07 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1643  ribonuclease HII  48.07 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  43.3 
 
 		 283 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  45.55 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>