More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2808 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2808  membrane fusion protein; cation efflux system protein  100 
 
 
353 aa  689    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3718  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.58 
 
 
353 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.0568343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.4 
 
 
350 aa  306  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.79 
 
 
352 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.39 
 
 
349 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4493  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.29 
 
 
367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 
354 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.71 
 
 
349 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.92 
 
 
353 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593708  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0972  secretion protein HlyD  29.55 
 
 
353 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1676  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.63 
 
 
367 aa  159  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  31.14 
 
 
355 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.52 
 
 
383 aa  139  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.27 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1044  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 
361 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0011899  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 
365 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 
365 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 
365 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 
365 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 
365 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 
365 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 
365 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.01 
 
 
375 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  29.41 
 
 
382 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  28.24 
 
 
348 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 
365 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  29.32 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.59 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  26.69 
 
 
381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 
355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  28.53 
 
 
403 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  25.56 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  28.53 
 
 
403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  25.4 
 
 
354 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  27.92 
 
 
351 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  27.92 
 
 
351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  25.4 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  25.21 
 
 
372 aa  116  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  27.93 
 
 
379 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.03 
 
 
358 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  29.27 
 
 
372 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  26.03 
 
 
358 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  29.65 
 
 
409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 
386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 
394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  25.72 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 
354 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  24.26 
 
 
360 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  27.76 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.66 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89791  normal  0.261432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  27.76 
 
 
382 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1672  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.86 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  25.5 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  26.14 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.39 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09530  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.21 
 
 
370 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  26.71 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 
354 aa  110  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.95 
 
 
397 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  24.86 
 
 
368 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  26.46 
 
 
373 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  24.01 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.78 
 
 
387 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  25.4 
 
 
354 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.68 
 
 
356 aa  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0623416  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 
376 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 
368 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  24.83 
 
 
365 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.4 
 
 
379 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.08 
 
 
380 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  24.72 
 
 
367 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.83 
 
 
365 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  25.56 
 
 
372 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  26.85 
 
 
371 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  25.33 
 
 
364 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  24.57 
 
 
366 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  26.35 
 
 
405 aa  106  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  24.23 
 
 
368 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1119  RND family efflux transporter MFP subunit  25.36 
 
 
369 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000371819  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  23.49 
 
 
363 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1580  RND family efflux transporter MFP subunit  26.21 
 
 
365 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186167  normal  0.460313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  26.71 
 
 
366 aa  104  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  24.86 
 
 
372 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  26.63 
 
 
377 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  24.18 
 
 
372 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5959  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.52 
 
 
383 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42426  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  24.5 
 
 
390 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  22.94 
 
 
352 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0948  secretion protein HlyD  24.8 
 
 
413 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.297274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3371  secretion protein HlyD  28.09 
 
 
370 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165029  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.94 
 
 
360 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.94 
 
 
360 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  26.04 
 
 
397 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  23.79 
 
 
359 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>