More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2714 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  100 
 
 		 648 aa  1345    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.23 
 
 		 673 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  32.54 
 
 		 620 aa  291  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  31.01 
 
 		 640 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  31.5 
 
 		 641 aa  270  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  34.35 
 
 		 519 aa  227  7e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  28.75 
 
 		 658 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  26.34 
 
 		 638 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  27.59 
 
 		 631 aa  191  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  25.55 
 
 		 656 aa  190  8e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  28.93 
 
 		 670 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  28.28 
 
 		 630 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  27.2 
 
 		 537 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  30.57 
 
 		 669 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  26.72 
 
 		 903 aa  173  9e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  28.46 
 
 		 704 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  26.69 
 
 		 694 aa  169  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  26.76 
 
 		 517 aa  161  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  24.56 
 
 		 710 aa  161  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  26.49 
 
 		 525 aa  160  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  24.64 
 
 		 631 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  27 
 
 		 673 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  24.16 
 
 		 679 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  26.61 
 
 		 712 aa  150  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  27.76 
 
 		 510 aa  146  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  24.78 
 
 		 653 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  25.95 
 
 		 650 aa  144  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  25.58 
 
 		 656 aa  140  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  26.01 
 
 		 668 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  24.96 
 
 		 626 aa  139  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  26.53 
 
 		 672 aa  137  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  24.2 
 
 		 665 aa  136  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  24.5 
 
 		 671 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  24.37 
 
 		 643 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  24.06 
 
 		 648 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  24.18 
 
 		 645 aa  131  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  24.66 
 
 		 666 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  23.49 
 
 		 660 aa  117  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  23.68 
 
 		 630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  25.67 
 
 		 509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 		 677 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  24.87 
 
 		 734 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  34.13 
 
 		 778 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  29.74 
 
 		 585 aa  107  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  26.11 
 
 		 594 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  22.56 
 
 		 642 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 712 aa  97.8  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  24.41 
 
 		 586 aa  94.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 543 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  35.8 
 
 		 613 aa  90.9  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  24.04 
 
 		 757 aa  90.9  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.09 
 
 		 542 aa  90.5  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  39.34 
 
 		 205 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 216 aa  89  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 216 aa  89  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  42.57 
 
 		 321 aa  88.2  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 544 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  41.75 
 
 		 233 aa  87.4  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 230 aa  87  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  40.59 
 
 		 215 aa  87  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  42.57 
 
 		 330 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  37.39 
 
 		 319 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 217 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  43.27 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.09 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 222 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 222 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.4 
 
 		 429 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  37.86 
 
 		 264 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  39.37 
 
 		 187 aa  83.2  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.19 
 
 		 623 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  33.33 
 
 		 212 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2530  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000768197  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2747  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.22 
 
 		 177 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  31.5 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2367  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000270429  normal  0.157295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2439  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000107401  normal  0.228998 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 1026 aa  81.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  37.04 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  41.35 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1608  OmpA domain-containing protein  39.22 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000267608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2790  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 388 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 369 aa  80.5  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  38.14 
 
 		 326 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.17 
 
 		 407 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 		 180 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618006  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  33.07 
 
 		 223 aa  79  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  43.56 
 
 		 334 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  34.91 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  42.59 
 
 		 227 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  46.84 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>