More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2701 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 361 aa  725    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  67.16 
 
 		 339 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.91 
 
 		 343 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  67.05 
 
 		 344 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  62.75 
 
 		 349 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  65.36 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.08 
 
 		 348 aa  431  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  63.64 
 
 		 344 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  48.7 
 
 		 363 aa  334  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.29 
 
 		 356 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  48.29 
 
 		 355 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.86 
 
 		 376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  48.21 
 
 		 356 aa  319  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.41 
 
 		 361 aa  315  6e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  48.9 
 
 		 377 aa  314  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  47.99 
 
 		 361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.01 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.23 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  48.56 
 
 		 360 aa  310  4e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.09 
 
 		 339 aa  309  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.09 
 
 		 339 aa  309  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.09 
 
 		 339 aa  309  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  46.53 
 
 		 367 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  46.41 
 
 		 352 aa  308  9e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.86 
 
 		 339 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.43 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  48.66 
 
 		 336 aa  305  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.51 
 
 		 339 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.39 
 
 		 339 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.93 
 
 		 340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.21 
 
 		 339 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.82 
 
 		 340 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.92 
 
 		 339 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.76 
 
 		 357 aa  301  9e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.04 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.24 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.06 
 
 		 342 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  49.4 
 
 		 370 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1593  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.82 
 
 		 339 aa  300  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000395197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.49 
 
 		 363 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.77 
 
 		 349 aa  295  7e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.73 
 
 		 378 aa  295  9e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  50.5 
 
 		 375 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  46.65 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.66 
 
 		 367 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 		 337 aa  293  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.16 
 
 		 377 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.94 
 
 		 341 aa  292  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.39 
 
 		 377 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.1 
 
 		 364 aa  292  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.45 
 
 		 339 aa  292  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.6 
 
 		 356 aa  291  9e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.6 
 
 		 356 aa  291  9e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.6 
 
 		 356 aa  291  9e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.36 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.09 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.04 
 
 		 360 aa  290  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.98 
 
 		 347 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.98 
 
 		 347 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.56 
 
 		 362 aa  290  4e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.63 
 
 		 364 aa  288  9e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.63 
 
 		 364 aa  288  9e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 336 aa  288  9e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2432  dihydroorotate oxidase A  47.98 
 
 		 355 aa  288  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0767712  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.46 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.16 
 
 		 354 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.04 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.72 
 
 		 362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  43.97 
 
 		 396 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.65 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 363 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4274  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.32 
 
 		 355 aa  286  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.637191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.73 
 
 		 336 aa  286  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  45.35 
 
 		 340 aa  286  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  45.16 
 
 		 335 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.64 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  44.35 
 
 		 342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.92 
 
 		 362 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.55 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.22 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  47.62 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.76 
 
 		 365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  47.83 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  47.83 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  45.77 
 
 		 377 aa  282  5.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  46.08 
 
 		 348 aa  282  6.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1857  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.02 
 
 		 338 aa  282  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.77 
 
 		 354 aa  282  8.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.77 
 
 		 354 aa  282  8.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  45.48 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.54 
 
 		 362 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  45.97 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  46.29 
 
 		 389 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.48 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.45 
 
 		 357 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>