More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2644 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2644  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 230 aa  467  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4546  ABC transporter related protein  71.68 
 
 		 238 aa  347  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0534927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  46.49 
 
 		 235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  44.49 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  44.84 
 
 		 234 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  43.61 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.7 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  46.85 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  45.87 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 		 286 aa  203  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  43.93 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 		 252 aa  201  6e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  45.41 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  45.45 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  42.73 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  42.15 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  44.5 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  43.75 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  42.15 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  43.06 
 
 		 642 aa  199  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.86 
 
 		 642 aa  198  7e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  44.5 
 
 		 232 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.64 
 
 		 258 aa  197  9e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  42.27 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  44.29 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  49 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  42.67 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  44.09 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  46.19 
 
 		 245 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  43.58 
 
 		 239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  43.52 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  42.99 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.78 
 
 		 640 aa  194  8.000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  41.55 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  41.86 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  44.29 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  44.04 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  43.17 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  43.58 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  43.58 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  43.06 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  44.7 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  40 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  41.18 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40 
 
 		 647 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  43.24 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  42.2 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  43.24 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  42.99 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  41.86 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  41.63 
 
 		 247 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  41.13 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  46.15 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  41.74 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  42.99 
 
 		 660 aa  191  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  43.84 
 
 		 227 aa  191  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  43.46 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  42.36 
 
 		 266 aa  191  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  41.47 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 		 224 aa  191  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  43.06 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  43.06 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  44.14 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0964  ABC transporter related  42.92 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  41.67 
 
 		 239 aa  190  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  43.52 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  45.54 
 
 		 408 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  41.2 
 
 		 653 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  42.99 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  44.75 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.13 
 
 		 648 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  41.07 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.84 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  41.18 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  40.55 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  41.55 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  44.5 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  42.47 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  42.47 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>